تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 744 |
تعداد مقالات | 7,079 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,193,690 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,873,920 |
ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی گونههای وحشی گندم با استفاده از نشانگرهای مولکولی ISSR و SSR | ||
تحقیقات غلات | ||
دوره 11، شماره 1، خرداد 1400، صفحه 43-54 اصل مقاله (275.51 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/cr.2021.20283.1684 | ||
نویسندگان | ||
فاطمه صغری وحدانی کیا1؛ حبیب اله سمیع زاده لاهیجی* 2؛ مهدی زهراوی3؛ محمد محسن زاده4 | ||
1دانشآموخته کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
2استاد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
3استادیار پژوهش، مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران | ||
4استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
چکیده | ||
در راستای اهمیت بررسی تنوع ژنتیکی و بهویژه ضرورت ارزیابی تنوع بین گونههای وحشی و خویشاوند گندم نان، پژوهش حاضر انجام شد که هدف از اجرای آن، ارزیابی تنوع ژنتیکی 52 ژنوتیپ گندم (49 ژنوتیپ وحشی خویشاوند گندم نان و سه ژنوتیپ از گندمهای زراعی بومی ایران) با استفاده از 10 نشانگر ISSR و دو نشانگر SSR بود. نتایج بهدست آمده نشان داد که در مجموع 12 نشانگر مورد مطالعه، تعداد 145 نوار چند شکل تولید کردند که میانگین تعداد نوارهای چند شکل برای نشانگرهای ISSR و SSR بهترتیب 4/11 و 5/15 نوار و تعداد آلل موثر بهترتیب 60/1 و 43/1 آلل بود. نشانگر 17899A با دارا بودن بیشترین تعداد آلل موثر (8/1)، شاخص تنوع ژنی نئی (44/0) و شاخص تنوع شانون (63/0)، باارزشترین نشانگر در این مطالعه بود. گروهبندی ژنوتیپها با استفاده از روش تجزیه خوشهای بر اساس ماتریس ضریب تطابق ساده و روش دورترین همسایهها، ژنوتیپهای مورد مطالعه را در پنج گروه بهترتیب شامل 10، 6، 24، 9 و 3 ژنوتیپ قرار داد و تجزیه تابع تشخیص نیز دقت گروهبندی حاصل را 100 درصد تعیین کرد. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی نیز نشان داد که چهار بردار اصلی مهمتر در مجموع 59/31 درصد از واریانس کل را توجیه کردند. گروهبندی ژنوتیپها با استفاده از بردارهای اول و دوم که بهترتیب 94/10 و 22/8 درصد از تغییرات دادهها را توجیه کردند، ژنوتیپها را در پنج گروه قرار دادند و سه ژنوتیپ زراعی و بومی گندم در مجاورت یکدیگر قرار گرفتند. در مجموع، نتایج حاصل نشان داد که نشانگرهای استفاده شده در این پژوهش چندشکلی قابل قبولی داشتند و بهعنوان نشانگرهای مفید و مطلوب جهت ارزیابی تنوع و تفکیک ژنوتیپهای گندم و احتمالاً سایر غلات معرفی میشوند. | ||
کلیدواژهها | ||
تجزیه تابع تشخیص؛ تجزیه به مختصات اصلی؛ شاخص نشانگری؛ محتوای اطلاعات چندشکلی | ||
مراجع | ||
Asadi, A. A. and Monfared, S. R. 2014. Characterization of EST-SSR markers in durum wheat EST library and functional analysis of SSR-containing EST fragments. Molecular Genetics and Genomics 289 (4): 625-640.##Brantestam, A. K., Von Bothmer, R., Dayteg, C., Rashal, I., Tuvesson, S. and Weibull, J. 2004. Inter simple sequence repeat analysis of genetic diversity and relationships in cultivated barley of Nordic and Baltic origin. Hereditas 141 (2).##Carvalho, A., Lima-Brito, J., Maçãs, B. and Guedes-Pinto, H. 2009. Genetic diversity and variation among botanical varieties of old Portuguese wheat cultivars revealed by ISSR assays. Biochemical Genetics 47 (3-4): 276-294.##Ghasemi, N., Mirfakhraii, R. G. and Abbasi, A. 2019. Assessment of genetic diversity of bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivars using microsatellite markers. Journal of Crop Breeding 11 (29): 9-16. (In Persian with English Abstract).##Goli, A., Jorjani, I., Sabouri, H. and Fallahi, H. 2016. Assessment of genetic diversity of facultative wheat genotypes belong to north of Iran using ISSR markers. Journal of Crop Breeding 8 (20): 165-174 (In Persian with English Abstract).##Hokanson, S., Szewc-McFadden, A., Lamboy, W. and McFerson, J. 1998. Microsatellite (SSR) markers reveal genetic identities, genetic diversity and relationships in a Malus domestica Borkh. core subset collection. Theoretical and Applied Genetics 97 (5-6): 671-683.##Khounani, Z., Naghavi, M., Omidi, M., Sabokdast, M. and Talebi Kohyakhi, E. 2011. Assessment of genetic diversity in the landraces of Ferula gummosa from Iran using AFLP marker. Journal of Medicinal Plants 10 (38): 117-126.##Kim, K.-H., Kamal, A. H. M., Shin, K.-H., Choi, J.-S., Heo, H.-Y. and Woo, S.-H. 2010. Large-scale proteome investigation in wild relatives (A, B, and D genomes) of wheat. Acta Biochimica et Biophysica Sinica 42 (10): 709-716.##Lavi, U., Akkaya, M., Bhagwat, A., Lahav, E. and Cregan, P. B. 1994. Methodology of generation and characteristics of simple sequence repeat DNA markers in avocado (Persea americana M.). Euphytica 80 (3): 171-177.##Mohammadi, M., Mirfakhraee, S. and Abbasi, A. 2014. Genetic diversity in bread wheat (Triticum aestivum L.) as revealed by microsatellite markers and association analysis of physiological traits related to spring cold stress. Modern Genetics Journal 3 (9): 279-288. (In Persian with English Abstract).##Mohammadi, S. A. and Prasanna, B. 2003. Analysis of genetic diversity in crop plants-salient statistical tools and considerations. Crop Science 43 (4): 1235-1248.##Mohsenzadeh, M., Samizadeh Lahiji, H., Aalami, A., Shoayi Deylami, M. and Talesh Sasani, S. 2012. Study of genetic diversity of flue-cured tobacco (Nicotiana tabacum L.) genotypes using ISSR and retrotransposon markers. Iranian Journal of Field Crop Science 43 (2): 371-380. (In Persian with English Abstract).##Najaphy, A., Parchin, R. A. and Farshadfar, E. 2011. Evaluation of genetic diversity in wheat cultivars and breeding lines using inter simple sequence repeat markers. Biotechnology and Biotechnological Equipment 25 (4): 2634-2638.##Nazari, M. and Abdolshahi, R. 2014. Evaluation of genetic diversity in bread wheat cultivars (Triticum aestivum L.) using morpho-physiological traits and SSR markers. Agricultural Biotechnology Journal 6 (1): 215-231.##Nevo, E. and Payne, P. 1987. Wheat storage proteins: Diversity of HMW glutenin subunits in wild emmer from Israel. Theoretical and Applied Genetics 74 (6): 827-836.##Pasqualone, A., Lotti, C., Bruno, A., De Vita, P., Di Fonzo, N. and Blanco, A. 2000. Use of ISSR markers for cultivar identification in durum wheat. In : Royo, C., Nachit, M., Di Fonzo, N. and Araus, J. L. (Eds.). Durum wheat improvement in the Mediterranean region: New challenges . Zaragoza: CIHEAM, 2000. pp: 157-161.##Rahmani, M., Rahimi, M., AbdoliNasab, M. and Maleki, M. 2019. Evaluation of genetic diversity of different bread wheat (Triticum aestivum L.) varieties using molecular markers ISSR and RAPD. Cellular and Molecular Researches (Iranian Journal of Biology) 34 (3): 248-262. (In Persian with English Abstract).##Röder, M. S., Korzun, V., Wendehake, K., Plaschke, J., Tixier, M.-H., Leroy, P. and Ganal, M. W. 1998. A microsatellite map of wheat. Genetics 149 (4): 2007-2023.##Salami, A., Pahlevani, M., Zenalinezhad, K. and Esmaeilzadeh Moghaddam, M. 2018. Genetic variation pattern of Iranian wheat landraces based on ISSR molecular markers and morphological traits. Journal of Plant Genetic Researches 5 (1): 87-100. (In Persian with English Abstract).##Saravani, S., Sabouri, H., Taliei, F., Biabani, A. and Rahemi Karizaki, A. 2019. Genetic diversity of wheat genotypes based on resistance to powdery mildew, grain yield, yield components and molecular markers. Agricultural Biotechnology Journal 11 (3): 57-82. (In Persian with English Abstract).##Shannon, C. E. 1948. A mathematical theory of communication. The Bell System Technical Journal 27 (3): 379-423.##Tanksley, S. D. and McCouch, S. R. 1997. Seed banks and molecular maps: unlocking genetic potential from the wild. Science 277 (5329): 1063-1066.##Thomas, K. G. and Bebeli, P. J. 2010. Genetic diversity of Greek Aegilops species using different types of nuclear genome markers. Molecular Phylogenetics and Evolution 56 (3): 951-961.##Yaghotipoor, A., Farshadfar, E. and Saeidi, M. 2019. Association analysis for drought tolerance indices in bread wheat using ISSR markers. Applied Crop Breeding 4 (1): 183-199. (In Persian with English Abstract).##Zargani, M., Ranjbar, G. A. and EbrahimNejad, S. 2015. Molecular assessment of genetic diversity among bread wheat (Triticum aestivum L.) doubled haploid lines using SSR markers. Journal of Crop Breeding 7 (15): 88-95. (In Persian with English Abstract).## | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,114 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 591 |