تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 743 |
تعداد مقالات | 7,073 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,149,576 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,857,547 |
بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت دهانگرد دریای خزر (Caspiomyzon wagneri Kessler, 1870) در رودخانه شیرود در فصلهای بهار و پاییز با روش مولکولی ریزماهواره | ||
فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان | ||
دوره 8، شماره 3، آذر 1399، صفحه 37-54 اصل مقاله (844.21 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/japb.2020.14192.1343 | ||
نویسندگان | ||
حامد مفتاح1؛ محمد علی سالاری علی آّبادی* 2؛ رحیم عبدی2؛ محمد پورکاظمی3؛ ایوب فرهادی4 | ||
1دکتری زیستشناسی دریا، گروه زیستشناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خرمشهر، ایران | ||
2دانشیار گروه زیست شناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خرمشهر، ایران | ||
3استاد موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، تهران، ایران | ||
4دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران | ||
چکیده | ||
در این پژوهش تنوع ژنتیکی دهانگرد دریای خزر در رودخانه شیرود توسط نشانگر ریزماهواره مورد مطالعه قرار گرفت. برای این منظور، از بافت نرم باله پشتی و دمی 67 قطعه ماهی بالغ از رودخانه شیرود در دو فصل پاییز 1395 و بهار 1396 نمونهبرداری شد. استخراج DNA ژنومی به روش استات آمونیوم و واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) با استفاده از 10 جفت آغازگر صورت گرفت. کمیت و کیفیت DNA با استفاده از روشهای اسپکتروفتومتری و الکتروفورز افقی ژل آگاروز 1 درصد بررسی و رنگآمیزی با روش نیترات نقره انجام شد. نتایج نشان داد که 6 جفت از آغازگرها چندشکل و 4 جفت تکشکل بودند. میانگین کل آللهای واقعی و موثر در ماهیان مولد پاییزه به ترتیب 66/2 و 88/1 و در ماهیان مولد بهاره 16/3 و 06/2 بود. همچنین هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار در ماهیان مولد پاییزه به ترتیب 101/0±239/0 و 116/0±363/0 و در ماهیان مولد بهاره 110/0±374/0 و 093/0±434/0 محاسبه شد. در بررسی تعادل هاردی- واینبرگ (H-W)، بیشتر لوکوسها خارج از تعادل بودند (05/0>P). میزان Fst و Rst به دست آمده بر اساس آزمون AMOVA، به ترتیب 153/0 و 200/0 بود که دارای اختلاف معنیداری بود (01/0>P). نتایج به دست آمده از این پژوهش نشان داد دو جمعیت مجزا از لحاظ ژنتیکی در رودخانه شیرود وجود دارد که در باسازی ذخایر آن باید توجه لازم را به کار گرفت. | ||
کلیدواژهها | ||
Caspiomyzon wagneri؛ ساختارژنتیکی؛ ریز ماهواره؛ رودخانه شیرود | ||
مراجع | ||
Abdoli A., Farokhnejad M.R., Nazari H. and Kiabi B. 2017. The role of temperature and daytime as indicators for the spawning migration of the Caspian lamprey Caspiomyzon wagneri Kessler, 1870. Journal of Applied Ichthyology, 33(3): 553–557.
Adams B. and Hutchings J.A. 2003. Microgeographic population structure of brook charr: A comparison of microsatellite and mark‐recapture data. Journal of Fish Biology, 62(3): 517–533. Ahmadi M., Amiri B.M., Abdoli A., Fakharzade S.M.E. and Hoseinifar S.H. 2011. Sex steroids, gonadal histology and biological indices of fall and spring Caspian lamprey (Caspiomyzon wagneri) spawning migrants in the Shirud River, Southern Caspian Sea. Environmental Biology of Fishes, 92(2): 229–235. Balloux F. and Lugon‐Moulin N. 2002. The estimation of population differentiation with microsatellite markers. Molecular Ecology, 11(2): 155–165. Bassam B.J., Caetano-Anolles G. and Gressshoff P.M. 1991. Fast and sensitive silver staining of DNA in polyacrylamide gels. Analytical Biochemistry, 196(1): 80–83. Beamish R.J. 1980. Adult biology of the river lamprey (Lampetra ayresi) and the Pacific lamprey (Lampetra tridentate) from the Pacific coast of Canada. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 37(11): 1906–1923. Beamish R.J. and Withler R.E. 1986. A polymorphic population of lampreys that may produce parasitic and a nonparasitic varieties. Indo-Pacific Fish Biology: Proceedings of the Second International Conference on Indo-Pacific Fishes. Ichthyological Society of Japan, Japan. P: 31–49. Coad B.W. 2016. Review of the Lampreys of Iran (Family Petromyzontidae). International Journal of Aquatic Biology, 4(4): 256–268. Dewoody J. and Avise J. 2000. Microsatellite variation in marine, freshwater, and anadromous fishes compared whit other animals. Journal of Fish Biology, 56: 461–473. Dorak M.T. 2005. Basic population genetics. Retrieved April 18, 2014, from http://www.dorak.info/ genetics/popgen.html. Gaigher A., Launey S., Lasen E., Besnard A.L. and Evanno G. 2013. Characterization of thirteen microsatellite markers in river and brook lampreys (Lampetra fluviatilis and L. planeri). Conservation Genetics Resources, 5(1): 141–143. Garcia De Leon F.J., Chikhi L. and Bonhomme F. 1997. Microsatellite polymorphism and population subdivision in natural populations of European sea bass Dicentrarchus labrax (Linnaeus, 1758). Molecular Ecology, 6(1): 51–62. Gess R.W., Coates M.I. and Rubidge B.S. 2006. A lamprey from the Devonian period of South Africa. Nature, 443(7114): 981–984. Hallerman E.M. 2003. Population Genetics: Principles and Applications for Fisheries Scientists. American Fisheries Society, USA. 475P. Hilborn R., Francis R.C. and Rogerse D.E. 2006. Marine and freshwater climatic factors affecting interannual variation in the timing of return migration to fresh water of sockeye salmon (Oncorhynchus nerka). Fisheries Oceanography, 15(1): 1–24. Holcik J. 1986. The Freshwater Fishes of Europe, Vol. 1, Part 1: Petromyzontiformes. AULA, Germany. 313P. Holcik J. and Olah J. 1992. Fish, fisheries and water quality in Anzali Lagoon and its watershed. Food and Agriculture Organization. http://www.fao.org/ 3/AD192E/AD192E00.htm. http://www.fao.org/3/AD192E/AD192E00.htm Imanpoor M.R. and Abdollahi M. 2011. Serum biochemical parameters of caspian lamprey (Caspiomyzon wagneri) during final spawning migration. World Applied Sciences Journal, 12(5): 600–606. Ivanov V.P. and Velasenko A.D. 2001. The relict fish of Caspian Sea, The sturgeon. Fish Farming and Fishing, 1: 20–21. Kelso J. and Gardner W. 2000. Emigration, upstream movement, and habitat use by sterile and fertile sea lampreys in three Lake Superior tributaries. North American Journal of Fisheries Management 20(1): 144–153. Kiabi B.H., Abdoli A. and Naderi M. 1999. Status of the fish fauna in the South Caspian Basin of Iran. Zoology in the Middle East, 18(1): 57–65. Kuszewski J. and Witkowski A. 1995. Morphometrics of the autumn spring run populations of the river lamprey, Lampetra fluviatilis [Linnaeus, 1758] from the Polish rivers. Acta Ichthyologica et Piscatoria 1(25): 57–70. Lazar I. and Lazar I. 2017. Gel Analyzer 2010a: Freeware 1D gel electrophoresis image analysis software. Lin B., Zhang Z., Wang Y., Kenneth P., Yamazaki Y. and Close D. 2008. Amplified fragment length polymorphism assessment of genetic diversity in Pacific lampreys. North American Journal of Fisheries Management, 28(4): 1182–1193. Lu C. 1998. Diversity of Cephalopoda from the waters around Taiwan. Phuket Marine Biological Center Special Publication, 18(2): 331–340. Maitland P.S., Morris K.H. and Est K. 1994. The ecology of lampreys (Petromyzonidae) in the Loch Lomond area. Hydrobiologia, 290(1-3): 105–120. Matthaeis E.D., Davolos D., Cobolli M. and Ketmaier V. 2000. Isolation by distance in equilibrium and nonequilibrium populations of four talitrid species in the Mediterranean Sea. Evolution, 54(5): 1606–1613. McFarlane C.T. and Docker M.F. 2009. Characterization of 14 microsatellite loci in the paired lamprey species Ichthyomyzon unicuspis and I. fossor and cross amplification in four other Ichthyomyzon species. Conservation Genetics Resources, 1(1): 377–380. McQuown E.C., Sloss B.L., Sheehan R.J., Rodzen J., Tranah G. and May B. 2000. Microsatellite analysis of genetic variation in sturgeon: New primer sequences for Scaphirhynchus and Acipenser. Transactions of the American Fisheries Society, 129(6): 1380–1388. Moser M.L., Matter A.L., Stuehrenberg L.C. and Bjornn T.C. 2002. Use of an extensive radio receiver network to document Pacific lamprey (Lampetra tridentata) entrance efficiency at fishways in the Lower Columbia River, USA. Pp 45–53 in Aquatic Telemetry, Springer. Nazari H. and Abdoli A. 2010. Some reproductive characteristics of endangered Caspian lamprey (Caspiomyzon wagneri Kessler, 1870) in the Shirud River southern Caspian Sea, Iran. Environmental Biology of Fishes, 88(1): 87–96. Nazari H., Abdoli A., Kiabi B. and Coad B. 2017. Biology and conservation status of Caspian lamprey of Iran: A review. Bull Lampetra, 8: 6–32. Nei M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89: 583–590. Peakall R. and Smouse P.E. 2006. GENALEX 6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6(1): 288–295. Quintella B., Andrade N., Koed A. and Almedia P.R. 2004. Behavioural patterns of sea lampreys’ spawning migration through difficult passage areas, studied by electromyogram telemetry. Journal of Fish Biology, 65(4): 961–972. Reisenbichler R. and Rubin S. 1999. Genetic changes from artificial propagation of Pacific salmon affect the productivity and viability of supplemented populations. ICES Journal of Marine Science, 56(4): 459–466. Rezvani Gilkolaei S. 1997. Molecular population genetic studies of sturgeon species in the South Caspian Sea. Ph.D. Thesis, University of Wales Swansea, UK. 196P. Ryman N. 1991. Conservation genetics considerations in fishery management. Journal of Fish Biology, 39: 211–224. Sambrook J. and Russell D.W. 2006. Isolation of high-molecular-weight DNA from mammalian cells using formamide. Cold Spring Harbor Protocols, 2006(1): pdb. prot3225. Schedina I.M., Pfautsch S., Hartmann S., Dolgener N., Polgar A., Bianco P., Tiedemann R. and Ketmairer V. 2014. Isolation and characterization of eight microsatellite loci in the brook lamprey Lampetra planeri (Petromyzontiformes) using 454 sequence data. Journal of Fish Biology, 85(3): 960–964. Shaklee J.B., Tamaru C.S. and Waples R.S. 1982. Speciation and evolution of marine fishes studied by the electrophoretic analysis of proteins. Pacific Science, 36(2): 141–157. Takeshima H., Yokoyama R., Nishida M. and Yamazaka Y. 2005. Isolation and characterization of microsatellite loci in the threatened brook lamprey Lethenteron sp. N. Molecular Ecology Notes, 5(4): 812–814. Thorpe J.P. and Sol-Cave A.M. 1994. The use of allozyme electrophoresis in vertebrate systematics. Zoologica Scripta, 23: 8–18. Waples R.S., Teel D.J., Myers J.M. and Marshall A.R. 2004. Life‐history divergence in Chinook salmon: Historic contingency and parallel evolution. Evolution, 58(2): 386–403. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,364 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 707 |