تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 743 |
تعداد مقالات | 7,072 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,134,713 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,852,141 |
شناسایی مکان های ژنی مرتبط با مقاومت گیاهچه ای به بیماری لکه قهوه ای معمولی جو با استفاده از روش تجزیه ارتباطی | ||
تحقیقات غلات | ||
مقاله 7، دوره 9، شماره 2، شهریور 1398، صفحه 179-192 اصل مقاله (330.41 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/c.2019.13707.1502 | ||
نویسندگان | ||
محمد امین مزینانی1؛ سعید نواب پور* 2؛ رضا اقنوم3؛ خلیل زینلی نژاد4؛ محمد علی دهقان5 | ||
1دانشجوی دکتری، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران | ||
2دانشیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران | ||
3استادیار پژوهش، بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران | ||
4استادیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران | ||
5استادیار پژوهش، بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان گلستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، گرگان، ایران | ||
چکیده | ||
بیماری لکه قهوهای معمولی با عامل قارچی Cochliobolus sativus یکی از بیماریهای مهم برگی جو است. بهمنظور شناسایی مکانهای ژنی مرتبط با مقاومت گیاهچهای به این بیماری در یک جمعیت جو بهاره دو ردیفه اروپایی شامل 142 رقم تجاری، از دادههای ژنوتیپی ۴۰۷ نشانگر AFLP و SSR و دادههای فنوتیپی حاصل از واکنش این ارقام نسبت به چهار جدایه عامل بیماری لکه قهوهای معمولی جو (جدایههای Csh-1 و Csh-16 از جو و Cst-42 و Cst-151 از گندم) استفاده شد. این جدایهها از استانهای مازندران، گلستان و خراسان رضوی جمعآوری شدند. نتایج نشان داد که بیشتر ارقام مورد مطالعه در مرحله گیاهچهای نسبت به جدایههای Csh-16 و Cst-42 مقاوم بودند، اما بیشترین تعداد واکنش حساسیت نسبت به جدایههای Csh-1 و Cst-151 مشاهده شد. بررسی ساختار جمعیت، لاینهای مورد مطالعه را به دو زیرجمعیت احتمالی (K=2) تقسیم کرد. تجزیه ارتباطی با استفاده از مدل خطی عمومی (GLM) بهترتیب شش و دوازده مکان ژنی و با استفاده از مدل خطی مخلوط (MLM) بهترتیب سه و چهار مکان ژنی مرتبط با مقاومت به جدایههای حاصل از برگ جو و گندم در سطح احتمال یک درصد (P≤0.01) شناسایی شد. این مکانهای ژنی روی کروموزومهای 2H، 3H، 5H، 6H و 7H نقشهیابی شدند. تمامی مکانهای ژنی شناسایی شده اختصاصی هر جدایه بودند و فقط نشانگر Bmag0225-161 با مقاومت به دو جدایه Cst-151 و Csh-1 مرتبط بود. نشانگرهای شناسایی شده پس از تأیید و اعتبارسنجی میتوانند در برنامههای بهنژادی برای تولید ارقام مقاوم به بیماری مورد استفاده قرار گیرند. | ||
کلیدواژهها | ||
نقشه یابی ارتباطی؛ AFLP؛ Cochliobolus sativus؛ SSR | ||
مراجع | ||
Aghnoum, R., Bvindi, C., Menet, G., D’hoop, B., Maciel, J. L. N. and Niks, R. E. 2019. Host/nonhost status and genetics of resistance in barley against three pathotypes of Magnaporthe blast fungi. Euphytica 215:116.##Arney, D.C. 1951. Inheritance of resistance to spot blotch in barley seedling. Journal of Phytopathology 41:691-698.##Bilgic, H., Steffenson, B.J. and Hayes, P.M. 2005. Comprehensive genetic analyses reveal differential expression of spot blotch resistance in four populations of barley. Theoretical and Applied Genetics 111: 1238-1250.##Bovill, J., Lehmensiek, A., Sutherland, M.W., Platz, G.J., Usher, T., Franckowiak, J. and Mace, E. 2010. Mapping spot blotch resistance genes in four barley populations. Molecular Breeding 26(4):653-666.##Buntjer, J.B., Sorensen, A.P. and Peleman, J.D. 2005. Haplotype diversity: The link between statistical and biological association. Trends in Plant Science 10:466-471.##Ershad, J. 2009. Fungi of Iran. (3rd Ed.). Iranian Research Institute of Plant Protection. Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO). (In Persian).##Evanno, G., Regnaut, S. and Goudet, J. 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: A simulation study. Molecular Ecology 14: 2611-2620.##Fetch, T.G. and Steffenson, B.J. 1994. Identification of Cochliobolus sativus isolates expressing differential virulence on 2-row barley genotypes from North-Dakota. Canadian Journal of Plant Pathology 16:202-206.##Fetch, T.G. and Steffenson, B.J. 1999. Rating scales for assessing infection responses of barley infected with Cochliobolus sativus. Plant Disease 83:213-217.##Griffee, F. 1925. Correlated inheritance of botanical characters in barley and the manner of reaction to Helminthosporium sativum. Journal of Agricultural Research 30:915-933.##Hittalmani, S., Huang, N., Courtois, B., Venuprasad, R., Shashidhar, H.E., Zhuang, J.Y., Zheng, K.L., Liu, G.F., Wang, G.C., Sidhu, J.S., Srivantaneeyakul, S., Singh, V.P., Bagali, P.G., Prasanna, H. C., McLaren, G. and Khush, G.S. 2003. Identification of QTL for growth and grain yield-related traits in rice across nine locations of Asia. Theoretical and Applied Genetics 107: 679-690.##Kraakman, A.T.W., Martínez, F., Mussiraliev, B., Eeuwijk, F.A.V. and Niks, R.E. 2006. Linkage disequilibrium mapping of morphological, resistance and other agronomically relevant traits in modern spring barley cultivars. Molecular Breeding17:41-58.##Kraakman, A.T.W., Niks, P.E., Van den Berg, P.M.M.M., Stam, P. and Van Eeuwijk, F.A. 2004. Linkage disequilibrium mapping of yield and yield stability in modern spring barley cultivars. Genetics Society of America 168: 435-446.##Lander, E.S. and Botstein, D. 1986. Strategies for studying heterogeneous genetic traits in humans by using a linkage map of restriction fragment length polymorphisms. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 83:7353-7357.##Leng, Y., Zhao, M., Wang, R., Steffenson, B.J., Brueggeman, R.S. and Zhong, Sh. 2018. The gene conferring susceptibility to spot blotch caused by Cochliobolus sativus is located at the Mlalocus in barley cultivar Bowman. Theoretical and Applied Genetics 131(7):1531-1539.##Nelson, P.E., Toussoun, T.A. and Marassas, W.F.O. 1983.Fusarium species: An illustrated manual for identification. Pennsylvania State University Press, University Park, New York.##Roy, J.K., Bandopadhyay, R., Rustgi, S., Balyan, H.S. and Gupta, P.K. 2006. Association analysis of agronomically important traits using SSR, SAMPL and AFLP markers in bread wheat. Current Science 90: 5-10.##Roy, J.K. Smith, K.P., Muehlbauer, G.J., Chao, S., Close, T.J. and Steffenson, B.J. 2010. Association mapping of spot blotch resistance in wild barley. Molecular Breeding 26: 243-256.##Sharma, R.C., Duveiller, E. and Jacquemin, J.M. 2007. Microsatellite markers associated with spot blotch resistance in spring wheat. Journal of Phytopathology 155: 316-319.##Steffenson B. J., Hayes, P. M. and Kleinhofs, A. 1996. Genetic of seedling and adult plant resistance to net blotch (Pyrenophora teres f. teres) and spot blotch (Cochliobolus sativus) in barley. Theoretical and Applied Genetics92 (7): 552-558.##Thornsberry, J.M., Goodman, M.M., Doebley, J., Kresovich, S., Nielsen, D. and Buckler, E.S. 2001. Dwarf8 polymorphisms associate with variation in flowering time. Nature Genetics 28: 286-289.##Wang, R., Leng, Y., Shaukat Ali, S., Wang, M. and Zhong, Sh. 2017. Genome-wide association mapping of spot blotch resistance to three different pathotypes of Cochliobolus sativus in the USDA barley core collection. Molecular Breeding 37:44.##Wilcoxon, R. D., Rasmusson, D. C. and Miles, M. R. 1990.Development of barley resistance to spot blotch abd genetic of resistance. Plant Disease 74 (3): 207-210. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 787 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 591 |