تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 748 |
تعداد مقالات | 7,108 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,240,444 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,898,038 |
تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیکی ناحیه تنظیمی بالادستی ژن های لپتین و SIGLEC5 در ارتباط با صفات تولیدی و تولیدمثلی در گاوهای هلشتاین | ||
تحقیقات تولیدات دامی | ||
مقاله 8، دوره 8، شماره 3، آذر 1398، صفحه 73-85 اصل مقاله (2.63 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/ar.2019.10474.1320 | ||
نویسندگان | ||
مریم حسین پور کل محله1؛ ایوب فرهادی* 2؛ قدرت رحیمی میانجی3؛ محسن قلی زاده2 | ||
1فارغ التحصیل کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح دام، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری | ||
2استادیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری | ||
3استاد گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری | ||
چکیده | ||
هدف از پژوهش حاضر تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیکی ناحیه تنظیمی بالادستی ژنهای لپتین و SIGLEC5 در ارتباط با صفات تولیدی و تولیدمثلی در گاوهای هلشتاین استان مازندران بود. بدین منظور تعداد 300 نمونه خون به طور تصادفی تهیه و استخراج DNA انجام شد. سپس دو قطعه 252 و 406 جفت بازی به ترتیب از ناحیه تنظیمی بالادست ژنهای لپتین و SIGLEC5 با PCR تکثیر و تعیین ژنوتیپها با روش SSCP انجام شد. از هر الگوی باندی یک نمونه توالییابی شده و بررسیهای بیوانفورماتیک با نرم افزارهای BioEdit و DNASIS MAX انجام شد. جایگاه SIGLEC5 در این پژوهش تک شکل بود، اما در جایگاه لپتین چهار الگوی باندی A، B، C و D به ترتیب با فراوانیهای 25/0، 36/0، 22/0 و 17/0 مشاهده شدند. بررسی آماری نشان داد که چندشکلیهای ژن لپتین با صفت چربی شیر و وضعیت زایش ارتباط معنیدار دارد (05/0>p )، به طوری که افراد دارای الگوی باندی A بیشترین چربی شیر و افراد دارای الگوی باندی D کمترین چربی شیر را نشان دادند. همچنین افراد دارای الگوی باندی D دارای بهترین وضعیت زایش (طبیعی) بودند (05/0>p ). بررسیهای بیوانفورماتیکی به ترتیب وجود 14 و نه موتیف را در ژنهای SIGLEC5 و لپتین نشان دادند. لذا، بر اساس نتایج این پژوهش، استفاده از ژن لپتین برای بهبود صفات تولیدی و تولیدمثلی پیشنهاد میشود. علاوه بر آن، انجام مطالعات تکمیلی روی سایر نواحی ژن SIGLEC5 در ارتباط با صفات تولیدمثلی و تولیدی در گاو هلشتاین اکیداً توصیه میشود. | ||
کلیدواژهها | ||
تولید؛ تولیدمثل؛ گاو هلشتاین؛ لپتین؛ SIGLEC5 | ||
مراجع | ||
Angata T., Margulies E. H., Green E. D. and Varki A. 2004. Large-scale sequencing of the CD33-related Siglec gene cluster in five mammalian species reveals rapid evolution by multiple mechanisms. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 101(36): 13251-13256.
Avril T., Freeman S. D., Attrill H., Clarke R. G. and Crocker P. R. 2005. Siglec-5 (CD170) can mediate inhibitory signaling in the absence of immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif phosphorylation. Journal of Biological Chemistry, 280(20): 19843-19851.
Clempson A. M., Pollott G. E., Brickell J. S., Bourne N. E., Munce N. and Wathes D. C. 2011. Evidence that leptin genotype is associated with fertility, growth, and milk production in Holstein cows. Journal of Dairy Science, 94(7): 3618-3628.
Cole J. B., VanRaden P. M., O’Connell J. R., Van Tassell C. P., Sonstegard T. S., Schnabel R. D. and Wiggans G. R. 2009. Distribution and location of genetic effects for dairy traits. Journal of Dairy Science, 92(6): 2931-2946.
Connolly N. P., Jones M. and Watt S. M. 2002. Human Siglec‐5: tissue distribution, novel isoforms and domain specificities for sialic acid‐dependent ligand interactions. British Journal of Hematology, 119(1): 221-238.
Crocker P. R., Paulson J. C. and Varki A. 2007. Siglecs and their roles in the immune system. Nature Reviews Immunology, 7(4): 255-266.
D’haeseleer P. 2006. What are DNA sequence motifs? Nature Biotechnology, 24:423-425.
Elmac C., Sahin S. and Oner Y. 2013. Distribution of different alleles of aromatase cytochrome P450 (CYP19) and melatonin receptor 1A (MTRN1A) genes among native Turkish sheep breeds. Journal of the Faculty of Veterinary Medicine, 19: 929-933.
Hinuy H. M., Hirata M. H., Forti N., Diament J., Sampaio M. F., Armaganijan D. and Hirata R. D. 2008. Leptin G-2548A promoter polymorphism is associated with increased plasma leptin and BMI in Brazilian women. Arquivos Brasileiros de Endocrinologia and Metabologia, 52(4): 611-616.
Lawlor T. J., VanRaden P.M., Null D., Levisee J. and Dorhorst B. 2014. Using haplotypes to unravel the inheritance of Holstein coat color. Proceeding of the 10th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production.
Leblanc S. J. 2013. Is a high level of milk production compatible with good reproductive performance in dairy cows? Animal Frontiers, 3 (4): 84-91.
Magni P., Motta M. and Martini L. 2000. Leptin: a possible link between food intake, energy expenditure, and reproductive function. Regulatory Peptides, 92(1): 51-56.
Mason M. M., He Y., Chen H., Quon M. J. and Reitman M. 1998. Regulation of Leptin Promoter Function by Sp1, C/EBP, and a Novel Factor 1. Endocrinology, 139(3): 1013-1022.
Melzner I., Scott V., Dorsch K., Fischer P., Wabitsch M., Brüderlein S. and Möller P. 2002. Leptin gene expression in human preadipocytes is switched on by maturation-induced demethylation of distinct CpGs in its proximal promoter. Journal of Biological Chemistry, 277(47): 45420-45427.
Miller S. G., De Vos P., Guerre-Millo M., Wong K., Hermann T., Staels B. and Auwerx J. 1996. The adipocyte specific transcription factor C/EBPalpha modulates human ob gene expression. Proceedings of the National Academy of Sciences, 93(11): 5507-5511.
Mounzih K., Qiu J., Ewart-Toland A. and Chehab F. F. 1998. Leptin is not necessary for gestation and parturition but regulates maternal nutrition via a leptin resistance state. Endocrinology, 139(12): 5259-5262.
Moussavi A. H., Ahouei M., Nassiry M. R. and Javadmanesh A. 2006. Association of leptin polymorphism with production, reproduction and plasma glucose level in Iranian Holstein Cows. Asian Australasian Journal of Animal Sciences, 19(5): 627-631.
Muller M. P., Rothammer S., Seichter D., Russ I., Hinrichs D., Tetens J., Thaller G. and Medugorac I. 2017. Genome-wide mapping of 10 calving and fertility traits in Holstein dairy cattle with special regard to chromosome 18. Journal of Dairy Science, 100(3): 1987-2006.
Patel N., Brinkman-Van der Linden E. C., Altmann S. W., Gish K., Balasubramanian S., Timans J. C. and Kastelein R. A. 1999. OB-BP1/Siglec-6 a leptin-and sialic acid-binding protein of the immunoglobulin superfamily. Journal of Biological Chemistry, 274(32): 22729-22738.
Shin S. C. and Chung E. R. 2007. Association of SNP marker in the leptin gene with carcass and meat quality traits in Korean cattle. Asian Australasian Journal of Animal Sciences, 20(1): 1-6.
Varki A. 2009. Natural ligands for CD33-related Siglecs? Glycobiology, 19(8): 810-812. Yoon D. H., Cho B. H., Park B. L., Choi Y. H., Cheong H. S. and Lee H. K. 2005. Highly Polymorphic Bovine Leptin Gene. Asian Australasian Journal of Animal Sciences, 18(11): 1548-1551. Zhang Y., Proenca R., Maffei M., Barone M., Leopold L. and Friedman J. M. 1994. Positional cloning of the mouse obese gene and its human homologue. Nature, 372(6505): 425-432. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 723 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 651 |