تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 748 |
تعداد مقالات | 7,112 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,245,997 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,899,757 |
بررسی تنوع مولکولی تودههای مختلف برنج هاشمی شمال کشور با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره | ||
تحقیقات غلات | ||
مقاله 1، دوره 7، شماره 1، خرداد 1396، صفحه 17-31 اصل مقاله (472.66 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/c.2017.2426 | ||
نویسندگان | ||
علیرضا ترنگ* 1؛ مریم حسینی2 | ||
1استادیار پژوهش، شعبه گیلان، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران | ||
2استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران | ||
چکیده | ||
تودههای محلی برنج ایران از دیرباز در نقاط مختلف برنجخیز کشور کشت میشوند. این تودهها طی سالیان متمادی به شرایط محیطی مختلف سازگار شدهاند و در نتیجه تنوع نسبتاً زیادی ممکن است در هر کدام از تودهها مشاهده شود. از چندین سال پیش تا کنون، کشت رقمی به نام هاشمی که از ارقام محلی برنج ایرانی است، رایج شده است، بهطوریکه بیشتر سطح زیر کشت استان گیلان و بخشی از نواحی استان مازندران و حتی برخی از استانهای دیگر هماکنون به رقم هاشمی اختصاص دارد. با اینحال، رقمی که با یک نام واحد هاشمی در مناطق مختلف کشور کشت میشود، از لحاظ ویژگیهای مرفولوژیک نظیر ارتفاع بوته و طول دوره رشد و حتی ویژگیهای ظاهری دانه تنوع بسیار زیادی نشان میدهد. اگرچه اثر عوامل محیطی بر ویژگیهای مرفولوژیک بسیار زیاد است، اما پرسش تحقیق حاضر این بود که آیا در درون این رقم تنوع ژنتیکی وجود دارد؟ برای دستیابی به پاسخ مناسب، ابتدا 87 ژنوتیپ همگی با نام رقم هاشمی شامل 30 ژنوتیپ از غرب استان گیلان، 42 ژنوتیپ از شرق استان گیلان و 15 ژنوتیپ از استان مازندران جمعآوری و در مزرعه آزمایشی موسسه تحقیقات برنج کشور در رشت در سال 1393 کشت شدند و سپس تنوع مولکولی آنها با 20 نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاصل از محاسبه همه شاخصهای تنوع نشان داد که تنوع نسبتاً زیادی در بین 87 ژنوتیپ مورد مطالعه وجود دارد و از اینرو میتوان نتیجهگیری کرد که آنچه که به نام رقم هاشمی در مناطق مختلف کشت میشود، در حقیقت یک توده بسیار متنوع است که در اثر استفاده از بذرهای خود مصرفی و احتمالاً اختلاط فیزیکی بذر ارقام مختلف و در نتیجه نوترکیبی بین آنها به یک توده بسیار متنوع تبدیل شده است. بنابراین، پیشنهاد میشود ضمن حفظ این ژنوتیپها در بانک ژن برنج ایران و احتمالاً استفاده از ویژگیهای مطلوب آنها در برنامههای بهنژادی، خالصسازی این توده متنوع نیز انجام شود تا بذر خالص بهترین ژنوتیپها در اختیار کشاورزان قرار گیرد. | ||
کلیدواژهها | ||
تنوع ژنتیکی؛ خلوص بذر؛ رقم هاشمی | ||
مراجع | ||
Benbouza, H., Jacquemin, J. M., Baudoin, J. P. and Mergeai, G. 2006. Optimization of a reliable, fast, cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in polyacrylamide gels. Biotechnology, Agronomy, Society and Environment 2: 77-81.##Don, R. H., Cox, P. T., Wainwright, B. J. and Mattick, J. S. 1991. Touchdown PCR to circumvent spurious priming during gene amplification. Nucleic Acid Research 19: 4008-4012.##FAO. 2014. Food and Agriculture Organization. Retrieved October 23, 2014. from http://fao.org/ faostat.##Giarrocco, L. E., Marassi, M. A. and Salerno, G. L.2007.Assessment of the genetic diversity in Argentine rice cultivars with SSR markers. Crop Science Society of America 47(2): 853-858.##Gramene. 2005. Retrieved October 19, 2005, from http://gramene.org/markers/microsat.##Hosseini Chaleshtori, M. and Sorkhe, K. 2015. Rice quality. Aspects of qualitative, molecular and genomic (Translation). Publications of Sina-Teb Institute Ltd, Tehran, Iran. (In Persian).##Hossain, M. M., Islam, M. M., Hossain, H., Ali, M. S., Teixeira da Silva, J. A., Komamine, A. and Prodhan, S. H. 2012. Genetic diversity analysis of aromatic landraces of rice (Oryza sativa L.) by microsatellite markers. Genes, Genomes and Genomics 6 (SI1): 42-47.##Kibria, K., Nur, F., Begum, S. N., Islam, M. M., Paul, S. K., Rahman, K. S. and Azam, S. M. M. 2009. Molecular marker based genetic diversity analysis in aromatic rice genotypes using SSR and RAPD markers. International Journal of Sustainable Crop Production 4 (1): 23-34.##Kimura, M. and Crow, J. F. 1964. The number of alleles that can be maintained in a finite population. Genetics 49: 725-738.##Lapitan, V. C., Brar, D. S., Abe, T. and Redona, E. D. 2007. Assessment of genetic diversity of Philippine rice carrying good quality traits using SSR markers. Breeding Science 57: 263-270.##Matin, S., Ashrafuzzaman, M., Monirul Islam, M. D., Sikdar, S. U. and Zobayer, N. 2012. Molecular marker based (SSR) genetic diversity analysis in deep water rice germplasms of Bangladesh. International Journal of Biosciences 10 (2): 64-72.##McCouch, S. R., Temnykh, L., Xu, Y. and Katarzyna, B. L. 2002. Development and mapping of 2240 new SSR markers for rice (Oryza sativa L.). DNA Research 9: 257-279.##Murray, M. G. and Thompson, W. F. 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acid Research 8: 4321-4325.##Nei, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided population. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 70: 3321-3323.##Nei, M. 1987. Mulecular phylogeny and genetic diversity analysis. Pennsylvania State University. University Park, PA 16802, USA.##Peakall, R. and Smouse, P. E. 2007. GeneAlex: Genetic analysis in excel. Ver. 6.2. Population genetic software for teaching and research. Canberra, Australian National University, Australia.##Prabakaran, A., Paramasivam, K., Rajesh, T. and Rajarajan, D. 2010. Molecular characterization of rice land races using SSR markers. Journal of Plant Breeding 1 (4): 512-516.##Prathepha, P. 2012. Genetic diversity and population structure of wild rice (Oryza rufipogon) from North Eastern Thailand and Laos. Australian Journal of Crop Science 4: 717-723.##Qi, Y. W., Zhang, D. L., Zhang, H. L., Wang, M. X., Sun, J. L., Liao, D. H., Wei, X. H., Qiu, Z. E., Tang, S. X., Cao, Y. S., Wang, X. K. and Li, Z. C. 2006. Genetic diversity of rice cultivars (Oryza sativa L.) in China and the temporal trends in recent fifty years. Chinese Science Bulletin 51: 681-688.##Rabey, H. E., Salem, F. K. and Mattar, M. Z. 2013. The genetic diversity and relatedness of rice (Oryza sativa L.) cultivars as revealed by AFLP and SSRs markers. Life Science Journal 10 (1): 1471-1479.##Rohlf, F. J. 2000. NTSYS-pc: Numerical taxonomy and multivariate analysis system. Ver. 2.02. Exeter Software. Setauket, New York.##Salgotra, R. K., Gupta, B. B. Bhat, J. A. and Sharma, S. 2015. Genetic diversity and population structure of Basmati rice (Oryza sativa L.) germplasm collected from North Western Himalayas using trait linked SSR markers. PLoS ONE 10 (7): e0131858.##Sarayloo, M., Sabouri, H. and Dadras, A. 2015. Assessing genetic diversity of rice genotypes using microsatellite markers and their relationship with morphological characteristics of seedling stage under non- and drought-stress conditions. Cereal Research 5 (1): 1-15. (In Persian with English Abstract).##Seetharam, K., Thirumeni, S. and Paramasivam, K. 2009. Estimation of genetic diversity in rice (Oryza sativa L.) genotypes using SSR markers and morphological characters. African Journal of Biotechnology 8 (10): 2050-2059.##Shah, S. M., Naveed, S. A. and Arif, M. 2013. Genetic diversity in basmati and non-basmati rice varieties based on microsatellite markers. Pakistan Journal of Botany 45: 423-431.##Singh, N., Choudhury, D. R., Singh, A. K., Kumar, S., Srinivasan, K., Tyagi, R. K., Singh, N. K. and Rakesh, S. 2013. Comparison of SSR and SNP markers in estimation of genetic diversity and population structure of Indian rice varieties. PLoS ONE 8 (12): e84136.##Tabkhkar, N., Rabiei, B. and Sabouri, A. 2012. Genetic diversity of rice cultivars by microsatellite markers tightly linked to cooking and eating quality. Australian Journal of Crop Science 6 (6): 980-985.##Takahata, N. and Nei, M. 1984. FST and GST statistics in the finite island model. Genetics 107: 501-504. ##Valizadeh, Z., Samizadeh, H. and Rabiei, B. 2014. Assessment ofmorphologic and genetic diversity of rice varieties using microsatellite markers associated with drought tolerance characteristics. Cereal Research 4 (2): 89-101. (In Persian with English Abstract). ##Wankhade, S. D., Cornejo, M. J. and Mateu-Andres, I. 2010. Microsatellite marker-based genetic variability in Spanish rice cultivars and landraces. Spanish Journal of Agricultural Research 8 (4): 995-1004.##Yeh, F. C., Yang, R. C. and Boyle, T. 1999. POPGENE: Microsoft window-based freeware for population genetics analysis. Version 1.32. University of Alberta, Edmonton. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,474 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 890 |