تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 748 |
تعداد مقالات | 7,108 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,240,583 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,898,139 |
بررسی تنوع ژنتیکی نمونه ای از ژرم پلاسم جو وحشی (Hordeum spontaneum) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR | ||
تحقیقات غلات | ||
مقاله 6، دوره 6، شماره 2، شهریور 1395، صفحه 201-214 اصل مقاله (784.54 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
عبدالمطلب نام آور1؛ زهرا طهماسبی* 2؛ جواد عرفانی مقدم3؛ فواد فاتحی4؛ زینب یوسفی1؛ بتول زارعی5 | ||
1دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران | ||
2استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران | ||
3استادیار، گروه باغبانی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران | ||
4استادیار، گروه کشاورزی دانشگاه پیام نور، تهران، ایران | ||
5دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران | ||
چکیده | ||
تعیین سطح تنوع ژنتیکی و روابط بین ژنوتیپها جهت شناسایی والدین مناسب برای اهداف اصلاحی مختلف ضروری است. در این تحقیق، روابط ژنتیکی 55 نمونه از ژرمپلاسم جو وحشی اسپونتانئوم (Hordeum spontaneum) متعلق به مناطق مختلف جهان با استفاده از 14 جفت آغازگر ریزماهواره بررسی شد. در مجموع 53 آلل با میانگین 2/5 آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. میانگین فراوانی آلل رایج 51/0 بود. میزان اطلاعات چند شکلی در دامنه 37/0 تا 81/0 با میانگین 63/0و تنوع ژنی یا هتروزیگوسیتی مورد انتظار در محدوده 38/0 تا 82/0 با میانگین 64/0 بود. نتایج حاصل از ارزیابی شاخصهای تنوع نشان داد که نشانگرهای Bmag007، EBmac0701 و Bmac134 مناسبترین نشانگرها برای تفکیک ژنوتیپها بودند. تجزیه خوشهای با روش UPGMA بر اساس دادههای مولکولی، ژنوتیپها را به شش گروه تقسیم کرد. ژنوتیپهای موجود در هر یک از گروهها، عموما از یک منطقه جغرافیایی خاص جمعآوری شده بودند. در تعدادی از نمونهها نیز تطابق بین توزیع جغرافیایی با گروهبندی ژنوتیپها مشاهده نشد. بر اساس نتایج، بیشترین شباهت را ژنوتیپهای سوریه و اردن و کمترین شباهت را نمونههای قزاقستان با این دو کشور داشتند. نتایج این تحقیق وجود تنوع ژنتیکی قابل توجه در نمونههای جو وحشی مورد مطالعه را نشان داد که با شناسایی ژنهای مفید، میتوان از آنها جهت اصلاح و بهبود ارقام زراعی استفاده کرد. | ||
کلیدواژهها | ||
تجزیه خوشه ای؛ چندشکلی؛ هتروزیگوسیتی | ||
مراجع | ||
Abdollahi Sisi, N., Mohammadi, S. A., Alavi-kia, S. S. and Sadeghzadeh, B. 2012. Efficiency of EST-SSR markers in determination genetic diversity and relationships of barley landraces. Cereal Research 2 (2): 83-93. (In Persian with English Abstract).#Chen, Z. W., Lu, R. J., Zou, L., Du, Z. Z., Gao, R. H. He, T. and Huang, J. H. 2012. Genetic diversity analysis of barley landraces and cultivars in the Shanghai region of China. Genetics and Molecular Research 11 (1): 644-650.#Ebrahimi, A., Naghavi, M. R., Sabokdast M. and Mardi M. 2010. Assessment of genetic diversity in accessions of two barely species (H. vulgare L. and H. spontaneum L.) using SSR markers. Iranian Journal of Crop Sciences 12 (3):333-345. (In Persian with English Abstract).#Frahani, E. and Arzani, A. 2004. The use of semi-random marker for evaluation of genetic diversity among cultivars and F1 hybrids of durum wheat. Proceeding of 4th International Iranian and Russian Conference. Russia. pp: 81-86.#Feng, Z. Y., Liu, X. J., Zhang, Y. Z., and Ling, H. Q. 2006. Genetic diversity analysis of Tibetan wild barley using SSR markers. Acta Genetica Sinica 33 (10): 917-928.#Gang Khanlu, A., Mohammadi S. A., Moghaddam, M., Ghasemi Golezani, K., Shakiba, M. and Yousufi, A. 2012. Genetic diversity in barley as revealed by microsatellite markers and Assaiation analysis of these markers by traits related to freezing tolerance. Seed and Plant Improvement Journal 28 (1): 101-114. (In Persian with English Abstract).#Gong, X., Westcott, S., Li, C., Yan, G., Lance, R. and Sun, D. 2009. Comparative analysis of genetic diversity between Qinghai-Tibetan wild and Chinese landrace barley. Genome 52: 849-861.#Guo, P., Baum, M., Grando, S., Ceccarelli, S., Bai, G., Li, R., Von Korff, M., Varshney, R. K., Graner, A. and Valkoun, J. 2009. Differentially expressed genes between drought-tolerant and drought sensitive barley genotypes in response to drought stress during the reproductive stage. Journal of Experimental Botany 60: 3531-3544.#Haidari, A., Mohammadi, S. A., Moghaddam, M., Shakiba, M., Ghasemi Golezani, K. and Yousufi, A. 2011.Evaluation of the genetic diversity of barley genotypes using SSR and EST-SSR markers. Iranian Journal of Crop Sciences 13 (1): 56-146. (In Persian with English Abstract).#Haj Mansour, S., Bihamta, M. A. , Mohammadi, A., Pyrsydy S. M. and Nikkhah H. R. 2010. Genetic diversity in barley genotypes. II: Microsatellite markers and morphological traits. Seed and Plant Improvment Journal 26 (2): 150-171. (In Persian with English Abstract).#Jilal, A., Grando, S., Henry, R. J., Lee, S., Rice, N.,Hill, H., Baum, M. and Ceccarelli, S. 2008. Genetic diversity of ICARDA’s worldwide barley landrace collection. Genetic Resources and Crop Evolution 55: 1221-1230.#Matus, I. A. and Hayes, P. M. 2002. Genetic diversity in three groups of barley germplasm assessed by simple sequence repeats. Genome 45: 1095-1106.#Meszaros, K., Karsai, I., Kuti, C., Banyai, J., Lang, L. and Bedo, Z. 2007. Efficiency of different marker systems for genotype fingerprinting and for genetic diversity studies in barley (Hordeum vulgare L.). South African Journal of Botany 73: 43-48.#Mohamadi, H. R. 2010. Genetic variation of seedless grapevine cultivars using RAPD and SSR markers. MS. C. Dissertation. Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran. (In Persian).#Mojirsheibani, E., Peyghambari, S. A., Yazdisamadi, B., Naghavi, M. R. and Ghadrdan, K. 2013. Evaluation of genetic diversity of barley (Hordeum vulgare L.) cultivars and relationship among traits using agronomic characteristics and molecular markers. Iranian Journal of Crop Sciences 15 (1): 46-59. (In Persian with English Abstract).#Nakhjavan, S., Bihamta, M. R., Darvish, F., Sorkhi, B. and Zahravi, M. 2012. Heritability of agronomic traits in the progenies of a cross between two drought tolerant and susceptible barley genotypes in terminal drought stress conditions. Iranian Journal of Crop Sciences 14 (2): 136-15. (In Persian with English Abstract).#Nie, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proceedings of the National Academy of Sciences 70: 3321-3323.#Park, S. K., Dong, J. L., Hyung-Jin, B., Jeongran, L. and Muhammad, F. 2011. Study of the genetic diversity of Korean, Chinese and Japanese landraces of barley (Hordeum vulgare L.) using microsatellites The Biodiversity: Research and Conservation 23: 3-13.#Powell, W., Morgante, M., Ander, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingy, S. and Rafalaski, A. 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding 2 (3): 225-238.#Ramsay, L., Macaulay, M., Ivanissevich, S., Maclen, K., Cardle, L., Fuller, J., Edwards, K. J., Tuvesson, S., Morgante, M., Massari, A., Maeatri, E., Marmiroli, N., Sjakste, T., Ganal, M., Powell, W. and Waugh, R. 2000. A simple sequence repeat-based linkage map of barley. Genetics 2: 1997-2005.#Roder, M. S., Korzun, V., Wendehake, K., Plaschke, J., Tixier, M. H., Leroy, P. and.Ganal, M. W. 1998. Microsatellite map of wheat. Genetics 149: 2007-2023.#Saghai-Maroof, M. A., Biyashev, R. M., Yang, G. P., Zhang, Q. and Allard, R. 1994. Extraordinarily polymorphic microsatellites DNA in barley genome mapping: Species diversity, chromosomal locations and population dynamics. Proceedings of the National Academy of Sciences 91: 5466-5470.#Salem, K. F. M., Varshney, R. K., Roder, M. S. and Borner, A. 2010. EST-SSR based estimates on functional genetic variation in a barley (Hordeum vulgare L.) collection from Egypt. GeneticResources and Crop Evolution 57: 515-521.#Shakhatreh, Y., Haddad, N., Alrababah, M., Grando,S. and Ceccarelli, S. 2009. Phenotypic diversity in wild barley (Hordeum vulgare L. ssp. Spontaneum (C. Koch) Thell.) accessions collected in Jordan. Genetic Resources and Crop Evolution 57: 131-146.#Turpeinen, T., Vanhala, T., Nevo, E. and Nissila, E. 2003. AFLP genetic polymorphism in wild barley (Hordeum spontaneum) populations in Israel. Theoretical and Applied Genetics 106: 1333-1339.#Varshney, R. K. Grosse, I., Hahnel, U., Prasad, M., Stein, N., Langridge, P., Altschmied,L. and Graner, A. 2005. Genetic mapping and BAC selection using EST-SSR markers provides an estimate on the gene space in the barely genome. Theoretical and Applied Genetics 113: 239- 250.#Wang, A., Yu, Z. and Ding, Y. 2009. Genetic diversity analysis of wild close relatives of barley from Tibet and the Middle East by ISSR and SSR markers. Comptes Rendus Biologies 332: 393-403.#Zahravi, M., Taghinejad, A. R., Afzalifar, A., Bihamta, M. R., Mozaffari, J. and Shafaedin, S. 2011. Evaluation of genetic diversity of agronomical traits in Hordeum spontaneum germplasm of Iran. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research 19 (1): 55-70. (In Persian with English Abstract). | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,677 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,076 |