پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 31 |
| تعداد شماره‌ها | 766 |
| تعداد مقالات | 7,260 |
| تعداد مشاهده مقاله | 10,624,035 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 7,094,056 |
بررسی ژن‌های کلیدی و miRNA های دخیل در تحمل به تنش خشکی در برنج (Oryza sativa L.) | ||
| تحقیقات غلات | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 01 بهمن 1403 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/cr.2025.29246.1844 | ||
| نویسندگان | ||
| سحر شجاعی1؛ محمد محسن زاده گلفزانی* 2؛ حبیب اله سمیع زاده لاهیجی3؛ مریم پسندیده ارجمند4 | ||
| 1دانشجوی دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
| 2دانشیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، | ||
| 3دانشگاه گیلان- ژنتیک مولکولی و بیومتری | ||
| 4دانش‌آموخته دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران پژوهشگر، واحدفناورزیست رادان | ||
| چکیده | ||
| مقدمه: گیاهان اغلب در معرض انواع تنش‌های محیطی مانند خشکی قرار می‌گیرند که سبب کاهش رشد و بهره‌وری محصول می‌گردد. از این رو هدف از انجام این مطالعه، شناسایی ژن‌های کلیدی و مسیرهای درگیر در تحمل به تنش خشکی و معرفی آن‌ها در راستای به‌نژادی گیاه برنج برای تحمل به تنش خشکی بود. مواد و روش‌ها: در این مطالعه، داده‌های میکروآرایه دو رقم برنج متحمل (Dagad deshi) و حساس (IR20) تحت تنش خشکی بررسی شد. با استفاده از ابزار GEO2R، ژن‌های تفریق‌یافته در این دو ژنوتیپ شناسایی شدند. مسیرهای بیولوژیکی، اجزای سلولی و عملکردهای مولکولی مرتبط با تحمل به خشکی در رقم متحمل تعیین شده و ژن‌های کلیدی و miRNAهای تنظیم‌کننده آن‌ها مورد تحلیل قرار گرفتند. یافته‌های تحقیق: آنالیز داده‌های میکروآرایه نشان داد که در شرایط تنش خشکی در رقم متحمل (Dagad deshi)، 33% ژنها افزایش و 26% ژنها کاهش بیان و در رقم حساس (IR20)، 7% ژنها افزایش و 6% ژنها کاهش بیان معناداری را داشتند. همچنین 766 ژن در هر دو رقم متحمل و حساس افزایش بیان و 340 ژن کاهش بیان معناداری را نشان دادند. معنادارترین فرآیندهای بیولوژیکی، اجزای سلولی و عملکردهای مولکولی در بین ژن‌های افزایش بیان یافته در رقم متحمل به ترتیب شامل پاسخ به سالیسیلیک اسید، سیتوپلاسم و فعالیت کربوکسی لیاز و در بین ژن‌های کاهش بیان یافته شامل مونومتیلاسیون پپتیدیل لیزین، زیر واحد بزرگ ریبوزومی میتوکندری و فعالیت آسیل CoA ردوکتاز با زنجیره بلند تشکیل دهنده الکل بود. تجزیه تحلیل غنی‌سازی مسیر KEGG نشان داد که ژن‌های افزایش و کاهش بیان یافته در رقم متحمل به ترتیب در18 و 10 مسیر غنی شدند. از بین ژن‌های تغییر بیان یافته 15 ژن کلیدی شامل MCM5، Os05g0358200، MCM4، MCM7، NAC037، OS11G0128400، CDC6، RPA2A، OS12G0124700، MCM3، POLA، Os07g0406800، MCM6، Os05g0160800 و PCNA انتخاب و به‌عنوان ژن‌های موثر در مسیر تحمل به تنش خشکی در برنج انتخاب شدند که چندین ژن از خانواده‌ی ژنی MCMs حضور داشتند. علاوه بر این، 247 miRNA از جمله osa-miR172c ، osa-miR1849، osa-miR2925، osa-miR397a و osa-miR397a برای ژن‌های موثر در مسیر تحمل به تنش خشکی در برنج شناسایی و معرفی شدند. نتیجه‌گیری: به نظر می‌رسد که بتوان از ژن‌های کلیدی و miRNAهای دخیل در تحمل به تنش خشکی شناسایی شده در این تحقیق به منظور به‌نژادی و تولید گیاهان متحمل به تنش خشکی در برنج استفاده کرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| سایتواسکیپ؛ تفرق‌بیان؛ میکرواری؛ miRNA؛ GO2R | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 47 |
||