پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 31 |
| تعداد شماره‌ها | 757 |
| تعداد مقالات | 7,162 |
| تعداد مشاهده مقاله | 10,347,677 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,937,331 |
تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei) | ||
| فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 12 آذر 1403 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/japb.2024.28614.1554 | ||
| نویسندگان | ||
| رضا پسندیده* 1؛ مجید پسندیده2 | ||
| 1عضو هیات علمی پژوهشکده میگوی کشور | ||
| 2استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران | ||
| چکیده | ||
| ویروس سندروم لکه سفید (WSSV) عامل بیماری لکه سفید (WSD) میباشد که طی دههای اخیر موجب ضررهای اقتصادی زیادی در صنعت جهانی پرورش میگو شده است. هدف از این تحقیق، شناسایی مسیرهای زیستی موثر و ژن‌های کلیدی مرتبط با بیماری لکه سفید در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei) بود. داده‌های ریزآرایه شامل 6 نمونه از بافت هپاتوپانکراس میگوهای سالم و 6 نمونه از بافت هپاتوپانکراس میگوهای آلوده به WSSV از پایگاه داده GEO با شماره دسترسی GSE4955 استخراج و با استفاده از ابزار GEO2R آنالیز شدند. سپس ژن‌های افتراقی با بیان معنیدار مشخص شدند. از نرم‌افزار آنلاین STRING به منظور ساخت شبکه بین ژن‌های افتراقی استفاده شد. سپس ژن‌های کلیدی با استفاده از افزونه CytoHubba در نرم‌افزار Cytoscape و با روش حداکثر مرکزیت دسته (MCC) شناسایی شدند. عملکرد پیشبینی شده ژن‌های کلیدی در ارتباط با بیوسنتز پروستاگلاندین، فاکتور هستهای کاپا B (NFKB)، پروتئین کیناز فعال شده با میتوژن (MAPK) و گیرنده گاما فعال شده با تکثیر پراکسیزوم (PPARG) بود. به نظر میرسد مسیرهای زیستی مربوط به این ژنها به ویژه ژن‌های NFKB و MAPK میتوانند در جهت شناسایی نشانگرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید، تشخیص و یا طراحی مهارکننده علیه آن بیماری مفید باشند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| آنالیز شبکه ژنی؛ برهمکنش پروتئینی؛ ریزآرایه؛ میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei)؛ ویروس سندروم لکه سفید (WSSV) | ||
| موضوعات | ||
| فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 17 |
||