پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 31 |
| تعداد شماره‌ها | 708 |
| تعداد مقالات | 6,652 |
| تعداد مشاهده مقاله | 9,200,156 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,311,793 |
کاربرد الگوریتم جنگل تصادفی در برآورد اثرات نشانگرها و تعیین ژن‌های کاندیدا صفات تولیدمثلی در گاو شیری هلشتاین ایران | ||
| تحقیقات تولیدات دامی | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 29 اسفند 1402 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/ar.2024.25557.1792 | ||
| نویسندگان | ||
| صادق علیجانی* 1؛ جیران جباری تورچی1؛ عباس رافت1؛ مختارعلی عباسی2 | ||
| 1دانشگاه تبریز | ||
| 2موسسه تحقیقات علوممؤسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی-کرج دامی کشور | ||
| چکیده | ||
| یادگیری ماشین رویکرد قدرتمندی برای مطالعات ژنومی است. هدف تحقیق حاضر استفاده از روش یادگیری ماشین (جنگل تصادفی) برای پویش ژنومی صفات تولید مثلی شامل سن در زمان اولین زایش (AFC)، روزهای باز (DO)، فاصله گوساله‌زایی (CI) و نرخ آبستنی دختران (DPR) در گاوهای هلشتاین ایران بود. اطلاعات لازم از مرکز اصلاح نژاد و بهبود تولیدات دامی کشور اخذ شد. اطلاعات ژنوتیپی شامل نشانگرهای چند شکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) مربوط به 2419 رأس گاو نر بود. فایل داده رکوردهای ثبت شده سال-های 1360 تا 1398 شامل 2،774،183 رأس دام بود. با توجه به تفاوت تراکم در اطلاعات ژنومی گاوهای نر، تعداد نشانگرهای آن‌ها نیز با یکدیگر متفاوت بود. برای یکسان سازی نشانگرها از نرم افزار FImpute برای جانهی ژنوتیپ استفاده گردید. در این تحقیق با استفاده از الگوریتم جنگل تصادفی که نمونه‌ای از الگوریتم‌های با نظارت و از نوع رگرسیونی هست، در مجموع 21 نشانگر با میزان اهمیت بالا برای صفات مختلف تولید مثلی مشخص شد. سپس از طریق روش هستی‌شناسی ژنی، ژن‌های پیشنهادی مهمی برای این صفات شناسایی شدند. ژن‌های MPZL1 و CD247 شناسایی شده بر روی کروموزوم 3 در رابطه با صفت AFC و ژن‌های RPS6KC1 و FAM170A در رابطه با صفت DPR برای بهبود عملکرد تولیدمثلی گاوهای شیری مهم بوده و می‌توانند مورد استفاده قرار بگیرند. نشانگرها و ژن‌های شناسایی شده در این تحقیق می‌توانند اطلاعات جدیدی را در مورد معماری ژنتیکی صفات تولیدمثلی برای بهبود ژنومی آن‌ها ارائه دهد و در طراحی تراشه‌ها برای ارزیابی صفات تولیدمثلی مورد استفاده قرار گیرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| جنگل تصادفی؛ ژنوتیپ؛ نشانگر و یادگیری ماشین | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 34 |
||