تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 748 |
تعداد مقالات | 7,112 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,247,885 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,900,925 |
گروهبندی برخی ژنوتیپهای سویا با تیمارهای مختلف تنش شوری در مرحله جوانهزنی بذر و استفاده از نشانگر مولکولی برای بررسی تنوع ژنتیکی | ||
علوم و تحقیقات بذر ایران | ||
مقاله 3، دوره 9، شماره 2، تیر 1401، صفحه 13-29 اصل مقاله (1.53 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/jms.2022.6149 | ||
نویسندگان | ||
مهدی پرکار1؛ محمد محسنزاده گلفزانی* 2؛ سید حسن حسنی کومله3؛ حبیب ا.. سمیعزاده لاهیجی4 | ||
1کارشناسی ارشد رشته بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
2استادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
3دانشیار، بیوشیمی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی- دانشکده علوم کشاورزی- دانشگاه گیلان | ||
4استاد گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
چکیده | ||
در این تحقیق کارآیی 11 نشانگر ISSR، دو نشانگر رتروترانسپوزون و 15 نشانگر ترکیبی ISSR + رتروترانسپوزون (REMAP) در 27 ژنوتیپ سویا، مورد ارزیابی قرار گرفتند. از 28 آغازگر تعداد 130 نوار چند شکل بهدست آمد. بیشترین درصد چندشکلی بهدست آمده 77 درصد برای UBC808 در نشانگرهای ISSR، 54 درصد برای TOS-2 در نشانگرهای رتروترانسپوزون و درصد چندشکلی در آغازگرهای ترکیبی در آغازگر UBC808+TOS-1، 70 درصد بهدست آمد. بالا بودن معیارهای تنوع ژنی نی، شاخص شانون و میزان PIC برای آغازگرهای UBC825، UBC811، TOS-2، HB-12، UBC834+TOS-1، UBC807+TOS-1، UBC807+TOS-2 و UBC808 نشاندهنده کارآیی بالای این آغازگرها در ارزیابی تنوع ژنتیکی در این تحقیق میباشد. نتایج حاصل از تجزیه خوشهای دادههای مولکولی به روش دورترین همسایه با استفاده از ترکیب دادههای نشانگرها 27 ژنوتیپها را در چهار گروه قرار داد، گروهها به ترتیب شامل چهار، نه، نه و پنج ژنوتیپ بود. تجزیه تابع تشخیص به روش خطی فیشر نشان داد که روش دورترین همسایه ژنوتیپها را با دقت 3/96 درصد جداسازی کرد. خصوصیات جوانه زنی بذر ژنوتیپهای سویا در سطوح مختلف تنش شاهد، 30، 60 و 90 میلیمولار NaCl در طرح فاکتوریل بر پایه طرح کاملاً تصادفی ارزیابی شد. نتایج حاصل از تجزیه واریانس نشان داد که تفاوت معنیداری بین ارقام، سطوح تنش از نظر تمامی صفات جوانهزنی اندازهگیری شده و برای اثر متقابل رقم × تنش برای تمامی صفات بهغیر از صفات وزن تر ساقهچه، وزن خشک ساقهچه، وزن خشک ریشهچه و تفاوت وزن تر و خشک ساقهچه وجود داشت. نتایج حاصل از تجزیه خوشهای دادههای جوانهزنی به روش دورترین همسایه با معیار فاصله اقلیدوسی، ژنوتیپهای مورد مطالعه را نیز در چهار گروه مجزا قرار داد. نتایج حاصل از تجزیه تابع تشخیص نشان داد که صحت گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای 6/92 درصد میباشد. همبستگی بین دو ماتریس تشابه دادههای جوانهزنی و مولکولی توسط آزمون مانتل معنیدار نبود. تجزیه و تحلیل ارتباط نشانگر با صفات جوانهزنی نشان داد باندهایی که موجب افزایش میانگین صفات مرتبط با تحمل به تنش شوری میشوند، میتوان برای شناسایی ژنوتیپهای متحمل سویا استفاده کرد. | ||
کلیدواژهها | ||
چندشکلی؛ تجزیه خوشهای؛ رتروترانسپوزون؛ ISSR؛ PIC | ||
مراجع | ||
Bourgeais-Chaillou, P., Perez-Alfocea, F. and Guerrier, G. 1992. Comparative effects of N–sources on growth and physiological responses of soyabean exposed to NaCI–stress. Journal of Experimental Botany, 43: 1225-33. (Journal) Burlacu, M.C., Calistru A.E. and Leonte, C. 2011. Evaluation of the genetic diversity among some oilseed rape (Brassica napus) cultivars revealed by RAPD markers compared with morphological traits evaluation. Lucrări Ştiinţifice, 54: 1-4. (Journal) Drazkiewicz, M. 1994. Chlorophyllase: occurrence, functions, mechanism of action, effects of external and internal factors (Review). Photosynthetica, 30:321–331. (Journal) Farokhi, A. and Ghaleshi, S. 2005. Investigation of the effect of salinity on seed size and their interactions on intensity, seed conversion efficiency and soybean seedling growth. Iranian Journal of Agriculture Science, 36: 1233-39. (In Persian( (Journal) Khan, F., Siddiqi, T.O., Mahmooduzzafar. and Ahmad A. 2009. Morphological changes and antioxidant defence systems in soybean genotypes as affected by salt stress. Journal of Plant Interactions, 4: 295-306. (Journal) Malekmohamadi, Z., Sabori, H., Biabani, A. and Hezarjaribi, E. 2017. Study of Genetic Diversity of Soybean (Glycine max) using ISSR Markers. Journal of Crop Breeding, 8: 133-24. (Journal) Mohsenzadeh Golfazani, M., Mohammad, F., Hasani Kumleh, S.H. and Samizadeh Lahiji, H. 2016. Grouping of some canola genotypes in various drought stress treatment in Germination Stages based on multivariate statistical methods. Iranian Journal of Seed Sciences and Research, 3: 53-65. (In Persian( (Journal) Mohsenzadeh Golfazani, M., Samizade Lahiji, H., Alami, A., Shoayi Deylami, M. and Talesh Sasani, S. 2012. Study of Genetic Diversity of Flue-Cured Tobacco (Nicotiana Tabacum L.) Genotypes using ISSR and Retrotransposon Markers. Iranian Journal of Field Crop Science, 43: 371-80. (In Persian( (Journal) Nei, M. 1972. Genetic distance between populations. The American Naturalist, 106: 283-92. (Journal) Niakan, M., Tajari, M. and Ghorbani, M. 2008. The effect of salinity stress on allelopathic potential of canola by studying some growth factors, chlorophyll a ,b amount, antioxidant enzyme and nitrate reductase activity of soybean seedlings in hydroponic culture. Iranian Journal of Biology, 21: 315-25. (In Persian( (Journal) Panjoo, M., Nazarian-Firouzabadi, F., Ismaili, A. and Ahmadi, H. 2014. Evaluation of Genetic Diversity among Soybean (Glycine max) Genotypes, Using ISJ and RAPD Molecular Markers. Journal of Plant Physiology and Breeding, 4: 55-65. (Journal) Saghai-Maroof, M.A., Soliman, K.M., Jorgensen, R.A. and Allard, R. 1984. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics. Proceedings of the National Academy of Sciences, 81(24): 8014-8018. (Journal) Scott, S., Jones, R. and Williams, W. 1984. Review of data analysis methods for seed germination 1. Crop science, 24: 1192-99. (Journal) Seitova, A.M., Ignatov, A.N., Suprunova, T.P., Tsvetkov, I.L., Deineko, E.V., Dorokhov, D.B., Shumnyi, V.K. and Skryabin, K.G. 2004. Genetic variation of wild soybean Glycine soja Sieb. et Zucc. in the far east region of the Russian Federation. Russian Journal of Genetics, 40: 165-71. (Journal) Senior, M., Murphy, J., Goodman, M. and Stuber, C. 1998. Utility of SSRs for determining genetic similarities and relationships in maize using an agarose gel system. Crop science, 38: 1088-98. (Journal) Shahnejat Bushehry, A. 2003. Genetic diversity in soybean as determined by RAPD and DAF markers. Iranian Journaof Agricultural Sciencesl, 34: 625-33. (In Persian ((Journal) Shannon, C.E. 1948. A mathematical theory of communication. The Bell system technical journal, 27: 379-423. (Journal) Younessi Hamzekhanlu, M., Izadi Darbandi, A., Halajian, M.T., Pirvali Byranvand, N. and Majdabadi, A. 2012. Investigation of genetic diversity of mutant soybean lines with high nitrogen fixation power using RAPD molecular markers. MG.genetics, 4: 49-54. (In Persian ((Journal) | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 260 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 201 |