تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 743 |
تعداد مقالات | 7,072 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,150,516 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,858,202 |
جایگاه فیلوژنتیکی جنس Nardo, 1827 Aphanius بر اساس توالییابی ژنوم کامل میتوکندریایی (ماهیان استخوانی؛ کپورماهیان دنداندار) | ||
فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان | ||
دوره 8، شماره 4، اسفند 1399، صفحه 55-70 اصل مقاله (947.19 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/japb.2021.16147.1376 | ||
نویسندگان | ||
آزاد تیموری* ؛ مینا معتمدی | ||
دانشیار گروه زیستشناسی، دانشکده علوم، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران | ||
چکیده | ||
خانواده کپورماهیان دنداندار متعلق به راسته کپورماهی شکلان دنداندار (ماهیان استخوانی عالی) است و ماهیان کوچکی را شامل میشود که غالبا ارزش زیباشناسی، کنترل بیولوژیکی و ارزش اکولوژیکی و زیستپزشکی دارند. برای مدت زمان طولانی کپورماهی دنداندار Aphanius در خانواده Cyprinodontidae قرار داشت. اما بر اساس مطالعات مولکولی، این جنس اخیرا در خانوادهای مجزا به نام Aphaniidae قرار گرفته است. به منظور ارزیابی اعتبار فیلوژنتیکی خانواده جدید Aphaniidae بر اساس ژنوم کامل میتوکندریایی، تعداد هفت خانواده از راسته کپورماهی شکلان دنداندار انتخاب و روابط فیلوژنتیکی آنها ترسیم و تجزیه و تحلیل شد. درخت فیلوژنی بر اساس دادههای بانک ژنی و نیز ژنوم کامل میتوکندریایی گونه کپورماهی دنداندار فارسی (Aphanius farsicus) به عنوان نماینده خانواده Aphaniidae رسم شد. نتایج نشان داد که رابطه فیلوژنتیکی نزدیکی بین جنس Aphanius (از خانواده Aphaniidae) و جنس Cyprinodon از خانواده (Cyprinodontidae) وجود دارد، به طوری که خانواده Aphaniidae با خانواده Cyprinodontidae گروه پارافیلتیک را تشکیل میدهند. بنابراین و با توجه به نزدیکی این دو جنس با یکدیگر، قرار دادن جنس Aphanius در خانوادهای مجزا به نامAphaniidae نیاز به مطالعه بیشتری دارد که با افزودن توالیهای بیشتر از اعضای جنس Aphanius، قابل بررسی است. | ||
کلیدواژهها | ||
Aphaniidae؛ Cyprinodontidae؛ Aphanius؛ میتوژنوم | ||
مراجع | ||
Esmaeili H.R., Coad B.W., Gholamifard A., Nazari N. and Teimori A. 2010. Annotated checklist of the freshwater fishes of Iran. Zoosystematica Rossica, 19: 361–386.
Esmaeili H.R., Teimori A., Gholami Z. and Reichenbacher B. 2014. Two new species of the tooth-carp Aphanius (Teleostei: Cyprinodontidae) and the evolutionary history of the Iranian inland and inland-related Aphanius species. Zootaxa, 3786: 246–268. Freyhof J., Ozulug M. and Sac G. 2017. Neotype designation of Aphanius iconii, first reviser action to stabilize the usage of A. fontinalis and A. meridionalis and comments on the family group names of fishes placed in Cyprinodontidae (Teleostei: Cyprinodontiformes). Zootaxa, 4294(5): 573–585. Fricke R., Eschmeyer W.N. and Van Der Laan R. 2019. Eschmeyer's Catalog of Fishes: Genera, Species, References. Retrieved April 30, 2019, from: http://researcharchive. calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatmain.asp. Gouy M., Guindon S. and Gascuel O. 2010. SeaView version 4: A multiplatform graphical user interface for sequence alignment and phylogenetic tree building. Molecular Biology and Evolution, 27: 221–224. Helmstetter A.J., Papadopulos A.S.T., Igea J., Van Dooren T.J.M., Leroi A.M. and Savolainen V. 2016. Viviparity stimulates diversification in an order of fish. Natural Communication, 2016: 1–7 (11271). Hrbek T. and Meyer A. 2003. Losing of the Tethys Sea and the phylogeny of Eurasian killifishes (Cyprinodontiformes: Cyprinodontidae). Journal of Evolutionary Biology, 16: 17–36. Hrbek T., Keivany Y. and Coad B. W. 2006. New species of Aphanius (Teleostei, Cyprinodontidae) from Isfahan Province of Iran and a reanalysis of other Iranian species. Copeia, 2: 244–255. Iranmanesh A. and Motamedi M. 2018. Histopathological changes of hepatorenal toxicity induced by gentamicin in Killifish, Aphanius hormuzensis (Aphaniidae) and its kidney regeneration through nephron neogenesis. Journal of Ichthyology, 58: 932–938. Kearse M., Moir R., Wilson A., Stones-Havas S., Cheung M., Sturrock S., Buxton S., Cooper A., Markowitz S., Duran C., Thierer T., Ashton B., Meintjes P., Miya M. and Nishida M. 2012. Use of mitogenomic information in teleostean molecular phylogenetics: A tree-based exploration under the maximum-parsimony optimality criterion. Molecular Phylogenetics and Evolution, 17(3): 437–455. Lowe T.M. and Chan P.P. 2016. tRNAscan-SE On-line: Integrating search and context for analysis of transfer RNA genes. Nucleic Acids Research, 44(1): 54–57. Miya M., Kawaguchi A. and Nishida M. 2001. Mitogenomic exploration of higher teleostean phylogenies: A case study for moderate-scale evolutionary genomics with 38 newly determined complete mitochondrial DNA sequences. Molecular Biology and Evolution, (18)11: 1993–2009. Motamedi M., Teimori A. and Iranmanesh A. 2021. Ontogenetic pattern, morphological sexual and side dimorphism in the saccular otolith of a scaleless killifish Aphanius furcatus (Teleostei: Aphaniidae). Acta Zoologica, 102(1): 38–50. Nelson J.S., Grande T.C. and Wilson M.V.H. 2016. Fishes of the World. Wiley, USA. 752P. Pohl M., Milvertz F.C., Meyer A. and Vences M. 2015. Multigene phylogeny of cyprinodontiform fishes suggests continental radiations and a rogue taxon position of Pantanodon. Vertebrate Zoology, 65(1): 37–44. Quezada-Romegialli C., Guerrero C.J., Veliz D. and Vila I. 2016. The complete mitochondrial genome of the endemic and threatened killifish Orestias ascotanensis Parenti, 1984 (Cyprinodontiformes, Cyprinodontidae) from the High Andes. Mitochondrial DNA (A), 27(4): 2798–2799. Reznick D.N., Furness A.I., Meredith R.W. and Springer M.S. 2017. The origin and biogeographic diversification of fishes in the family Poeciliidae. PLoS One, 12(3): 1–20 (e0172546). Setiamarga Zhang X.Y., Yue B.S., Jiang W.X. and Song Z. 2009. The complete mitochondrial genome of rock carp Procypris rabaudi (Cypriniformes: Cyprinidae) and phylogenetic implications. Molecular Biology Report, 36(981): 981–991. Stamatakis A. 2006. RAxML-VI-HPC: Maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands of taxa and mixed models. Bioinformatics, 22: 2688–2690. Teimori A., Esmaeili H.R. and Reichenbacher B. 2011. Aphanius farsicus, a replacement name for A. persicus (Jenkins, 1910) (Teleostei, Cyprinodontidae). Zootaxa, 3096(1): 53–58. Teimori A., Esmaeili H.R., Erpenbeck D. and Reichenbacher B. 2014. A new and unique species of the genus Aphanius (Teleostei: Cyprinodontidae) from Southern Iran: A case of regressive evolution. Zoologischer Anzeiger, 253: 327–337. Teimori A., Esmaeili H.R., Hamidan N. and Reichenbacher B. 2018. Systematics and historical biogeography of the Aphanius dispar species group (Teleostei: Aphaniidae) and description of a new species from Southern Iran. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 56: 579–598. Wildekamp R.H. 1993. A World of Killies: Atlas of the Oviparous Cyprinodontiform Fishes of the World. American Killifish Association, USA. 311P. Zeinali F. and Motamedi M. 2017. The regeneration capacity of caudal fin in the common tooth-carp, Aphanius dispar (Ruppell, 1829) (Teleostei: Cyprinodontidae). International Journal of Aquatic Biology, 5: 321–327. Zhang X.Y., Yue B.S., Jiang W.X. and Song Z. 2009. The complete mitochondrial genome of rock carp Procypris rabaudi (Cypriniformes: Cyprinidae) and phylogenetic implications. Molecular | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 868 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 693 |