تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 748 |
تعداد مقالات | 7,112 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,246,356 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,899,976 |
صفات مرتبط با تحمل به تنش خشکی و ارتباط آن با نشانگر AFLP در ژنوتیپهای گندم نان | ||
تحقیقات غلات | ||
دوره 9، شماره 4، اسفند 1398، صفحه 359-371 اصل مقاله (271.42 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/cr.2020.15854.1575 | ||
نویسندگان | ||
فرزاد آهک پز1؛ اسلام مجیدی هروان* 2؛ مظفر روستایی3؛ محمد رضا بی همتا4؛ سلیمان محمدی5 | ||
1دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران | ||
2استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران | ||
3دانشیار پژوهش، بخش غلات، موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور، سازمان تحقیقات، آموزش، و ترویج کشاورزی، مراغه، ایران | ||
4استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
5استادیار پژوهش، بخش غلات، ایستگاه تحقیقات کشاورزی میاندواب، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، میاندواب، ایران | ||
چکیده | ||
بهمنظور شناسایی نشانگرهای مرتبط با صفات وابسته به تحمل به خشکی تحت دو شرایط متفاوت رطوبتی، دیم (تنش خشکی) و آبیاری تکمیلی، آزمایشی در دو سال متوالی (94-1392) اجرا شد. از بین آغازگرهای AFLP مورد استفاده، هشت ترکیب آغازگری EcoRI/MseI در مجموع 119 نوار چندشکل با میانگین 88/14 نوار بهازای هر نشانگر تولید کردند. متوسط محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) برای کلیه نشانگرها 298/0 محاسبه شد. بر اساس آمارههای تنوع ژنتیکی ارزیابی شده شامل PIC، شاخص شانون (I)، هتروزیگوسیتی مورد انتظار (He) و تعداد آللهای موثر (EA)، ترکیب E-ACT/M-CTT بهعنوان بهترین ترکیب آغازگر در تفکیک ژنوتیپهای مورد مطالعه شناسایی شد. ارتباط بین صفات آگرو-فیزیولوژیک بهعنوان متغیرهای وابسته و دادههای مولکولی بهعنوان متغیرهای مستقل از طریق تحلیل رگرسیون چندگانه به روش گام به گام مورد بررسی قرار گرفت و 76 و 98 نشانگر پیوسته با صفات مورد مطالعه بهترتیب در شرایط دیم و آبیاری تکمیلی شناسایی شد. در شرایط آبیاری تکمیلی، بالاترین ضریب تبیین به نشانگر E-ACT/M-CTC-11 با توجیه بیش از 60 درصد تغییرات وزن پدانکل، طول پدانکل، وزن خشک سنبله و وزن دانه در سنبله و نشانگر E-ACT/M-CTT-8 با توجیه 62 درصد از تغییرات وزن هزار دانه اختصاص یافت. در شرایط دیم نیز نشانگر E-ACT/M-CTT-8 با 70 درصد، نشانگر E-ACG/M-CTG-2 با 57 درصد و نشانگر E-ACG/M-CAA-2 با 51 درصد، بهترتیب بالاترین میزان تغییرات وزن هزار دانه، نسبت آب از دست رفته و محتوای آب نسبی برگ را تبیین کردند. نشانگرهای E-ACT/M-CTC-11 و E-ACG/M-CAA-20 نیز 32 و 41 درصد از تغییرات عملکرد دانه را بهترتیب تحت شرایط آبیاری تکمیلی و دیم توجیه کردند. در این پژوهش، نشانگرE-ACT/M-CTT-8 بهطور مشترک بیش از 60 درصد از تغییرات وزن هزار دانه را تحت هر دو شرایط آزمایشی توجیه کرد. نتایج این تحقیق میتواند در تامین اطلاعات اولیه برای انتخاب غیرمستقیم صفات گندم از طریق نشانگرهای مرتبط با تحت شرایط دیم مفید باشد. | ||
کلیدواژهها | ||
تجزیه رگرسیون؛ صفات آگروفیزیولوژیک؛ محتوای آب نسبی برگ؛ نسبت آب از دست رفته؛ نشانگرهای مولکولی | ||
مراجع | ||
Altıntas, S., Toklu, F., Kafkas, S., Kilian, B., Brandolini, A. and Ozkan, H. 2008. Estimating genetic diversity in durum and bread wheat cultivars from Turkey using AFLP and SAMPL markers. Plant Breeding 127: 9-14.##Balta, H., Karakas, O., Senturk, F., Ertugrul, F., Hasancebi, S., Aydin, Y. and Mert, Z. 2014. Identification of an AFLP marker linked with yellow rust resistance in wheat. Turkish Journal of Biology 38: 371-379.##Beyer, S., Daba, S., Tyagi, P., Bockelman, H., Brown, G. and Mohammadi, M. 2019. Loci and candidate genes controlling root traits in wheat seedlings- a wheat root GWAS. Functional and Integrative Genomics 19: 91-107.##Bhatta, M., Morgounov, A., Belamkar, V. and Baenziger, P. S. 2018. Genome-wide association study reveals novel genomic regions for grain yield and yield-related traits in drought-stressed synthetic hexaploid wheat. International Journal of Molecular Sciences 19: 3011.##Ejaz, M., Qidi, Z., Gaisheng, Z., Na, N., Huiyan, Z. and Qunzhua, W. 2015. Analysis of genetic diversity identified by amplified fragment length polymorphism marker in hybrid wheat. Genetics and Molecular Research 14 (3): 8935-8946.##Hafeez, S., Zhangyong, L., Tao, J., Iqbal, S., Ahmad, I. and Chambi, C. 2016. Assessment of drought tolerance in wheat at different growth stages under the rainfed conditions of Rawalakot Kashmir Pakistan. Advanced Research Journal of Agricultural Science 5 (4): 132-140.##Hu, H. and Xiong, L. 2014. Genetic engineering and breeding of drought-resistant crops. Annual Review of Plant Biology 65: 715-741.##Karakas, O., Turktas, M., Aslay, M. and Kaya, E. 2013. Evaluation of the genetic relationship between Fritillaria species from Turkey,s flora using fluorescent-based AFLP. Turkish Journal of Biology 37: 273-279.##Khalili, M. and Mohammadi, A. 2016. Mapping QTLs associated with wheat seed germination under normal and drought stress conditions. Crop Biotechnology 9: 1-14. (In Persian with English Abstract).##Khan, S., Anwar, S., Yu, S., Sun, M. and Gao, Z. 2019. Development of drought-tolerant transgenic wheat: Achievements and limitations. International Journal of Molecular Sciences 20: 1-18.##Lewontin, R. C. 1972. The apportionment of human diversity. Evolutionary Biology 6: 381-398.##Lynch, M. and Milligan, B. G. 1994. Analysis of population genetic structure with RAPD markers. Molecular Ecology 3: 91-99.##Mathew, I., Shimelis, H., Shayanowako, A., Laing, M. and Chaplot, V. 2019. Genome-wide association study of drought tolerance and biomass allocation in wheat. Plos One 14 (12): e0225383.##Ministry of Agriculture 2003. Farm management and wheat technical instructions. Wheat project manager. Volume II. 57 p. (In Persian).##Mohammadi, M., Mirfakhraee, R. and Abbasi, A. 2015. Genetic diversity in bread wheat (Triticum aestivum L.) as revealed by microsatellite markers and association analysis of physiological traits related to spring cold stress. Novel Genetics 3: 279-288. (In Persian with English Abstract).##Mwadzingeni, L., Shimelis, H., Rees, D. and Tsilo, T. 2017. Genome-wide association analysis of agronomic traits in wheat under drought-stressed and non-stressed conditions. Plos One 12 (2): e0171692.##Nyquist, N. E. 1991. Estimation of heritability and prediction of selection response in plant populations. Critical Reviews in Plant Sciences 10: 235-322.##Peakall, R. and Smouse, P. 2012. GenAlEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics 28: 2537-2539.##Petrovic, S., Maric, S., Cupic, T., Drezner, G. and Karsai, I. 2012. Assessment of genetic diversity in croatian winter wheat varieties using SSR and AFLP markers. Poljoprivreda 18 (2): 18-24.##Qaseem, M., Qureshi, R., Muqaddasi, Q., Shahin, H. and Roder, M. 2018. Genome-wide association mapping in bread wheat subjected to independent and combined high temperature and drought stress. Plos One 13: e0199121.##Ranjbar, M., Naghavi, M., Zali, A., Aghaei, M. and Mardi, M. 2009. Identification of informative markers of SSR in Aegilops crassa accessions of Iran. Journal of Agriculture 11: 47-56.##Razegi Yadak, F. and Tavakkol Afshari, R. 2010. Effect of drought stress on seed embryo axis phosphatase activities during early stages of germination of two bread wheat (Triticum aestivum) cultivars. Journal of Crop Science 2: 385-393. (In Persian with English Abstract).##Ritchie S. W., Nguyen H. T., and Holdy A. S. 1990. Leaf water content and gas exchenge parameters of two wheat genotypes differing in drought resistance. Crop Science 30: 105-111.##Roldan-Ruiz, I., Dendauw, J., VanBockstaele, E., Depicke, A. and Loose, M. 2000. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lolium spp.). Molecular Breeding 6: 125-134.##Roncallo, P. F., Beaufort, V., Larsen, A. O. Dreisigacker, S. and Echenique, V. 2019. Genetic diversity and linkage disequilibrium using SNP (KASP) and AFLP markers in a worldwide durum wheat (Triticum turgidum L. var durum) collection. Plos One 14 (6): e0218562.##Sadeqi, M., Dadshani, S., Yousefi, M. and Ajir. G. 2019. Investigation of genetic diversity in afghan bread wheat genotypes using SSR and AFLP markers. Turkish Journal of Agriculture-Food Science and Technology 7 (9): 1263-1267.##Saghai Maroof, M. A., Biyashev, R. M. and Yang, G. P. 1994. Extraordinarily polymorphic microsatillate DNA in barely species diversity, choromosomal location, and population dynamics. Proceeding of the National Academy of Sceinces of the united States of America 91 (12): 5466-5570.##Sallam, A., Alqudah, A. M., Dawood, M., Baenziger, P. S. And Borner, A. 2019. Drought stress tolerance in wheat and barley: advances in physiology, breeding and genetics research. International Journal of Molecular Sciences 20: 1-36.##Saremi Rad, B., Shokrpour, M., Sofalian, O., Hashemi Nezhad, E., Avanes, A. and Esfandiari, E. 2016. Evaluation of genetic diversity of wheat genotypes by AFLP markers. Journal of Crop Breeding 7 (16): 89-96. (In Persian with English Abstract).##Senapati, N., Stratonovitch, P., Paul, M. J. and Semenov, M. A. 2019. Drought tolerance during reproductive development is important for increasing wheat yield potential under climate change in Europe. Journal of Experimental Botany 70: 2549-2560.##Sonmezoglu, O. and Terzi, B. 2018. Characterization of some bread wheat genotypes using molecular markers for drought tolerance. Journal of Plant Physiology and Molecular Biology 24 (1):159-166.##Sukumaran, S., Reynolds, M. P. and Sansaloni, C. 2018. Genome-wide association analysis identify QTL hotspots for yield and component traits in durum wheat grown under yield potential, drought, and heat stress environments. Frontiers in Plant Science 9: 81. doi: 10.3389/fpls.2018.00081.##Talebi, R. and Fayyaz, F. 2012. Quantitative evaluation of genetic diversity in Iranian modern cultivars of wheat (Triticum aestivum L.) using morphological and amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Biharean Biologist 6: 14-18.##Talebi, R., Fayaz, F. and Karami, E. 2012. Morphometric and amplified fragment length polymorphism marker analysis in some landrace wheat (Triticum aestivum L.) genotypes collected from north-west Iran. Environmental and experimental biology 10: 49-56.##Thomas, S. G. 2017. Novel Rht-1 dwarfing genes: tools for wheat breeding and dissecting the function of DELLA proteins. Journal of Experimental Botany 68 (3): 354-358.##Varshney, R., Chabane, K., Hendre, P. and Aggarwal, R. 2007. Comparative assessment of EST-SSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science 173: 638-649.##Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, T., Hornes, M., Peleman, J. and Kuiper, M. 1995. AFLP: A new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Research 21: 4407-4414.##Watanabe, K., Stringer, S., Frei, O., Umicevic, M., Leeuw, C., Polderman, T., Sluis, S., Andreassen O., Neale, B. and Posthuma, D. 2019. A global overview of pleiotropy and genetic architecture in complex traits. Nature Genetics 51: 1339-1348.##Zhu, Q., Zhang, X., Ejaz, M., Zhang, G. and Zhang, L. 2013. Analysis of three wheat cytoplasmic malesterile lines mitochondrial DNA by AFLP. Chinese Journal of Biotechnology 29: 646-656.##Zoric, M., Doding, D., Kobiljski, B., Quarrie, S. and Barnes, J. 2012. Population structure in a wheat core collection and genomic loci associated with yield under contrasting environments. Genetica 140: 259-275.## | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 850 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 637 |