تعداد نشریات | 31 |
تعداد شمارهها | 748 |
تعداد مقالات | 7,108 |
تعداد مشاهده مقاله | 10,240,889 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,898,406 |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی | ||
تحقیقات تولیدات دامی | ||
مقاله 4، دوره 1، شماره 1، خرداد 1391، صفحه 29-36 اصل مقاله (215.08 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
نویسندگان | ||
ثریا رفیعی1؛ مرادپاشا اسکندری نسب* 2؛ داریوش سلیمی3؛ طاهر هرکی نژاد3؛ روناک خرمتایی3 | ||
1دانشآموخته کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان | ||
2دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان | ||
3پژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان | ||
چکیده | ||
در تحقیق حاضر اقدام به تولید نرمافزار MAS شد. این نرمافزار برای پیشبینی ارزش ارثی از تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی استفاده مینماید. بعضی از ژنهایی که یک صفت را کنترل میکنند، میتوانند نسبت به بقیه دارای اثرات بزرگی باشند. این قبیل ژنها، ژنهای با اثر بزرگ نامیده میشوند که در QTL هامکانیابی میشوند. دنبال کردن الگوی توارث این قبیل QTLها میتواند برای کمک به انتخاب مورد استفاده قرار بگیرد. این موضوع مجالی برای افزایش برنامههای پیشرفت ژنتیکی حیوانات اهلی به وسیله انتخاب به کمک نشانگرها (MAS) را فراهم میسازد. کارایی انتخاب به کمک نشانگرها بر شاخصی متشکل از اطلاعات فنوتیپی و مولکولی پایه گذاری شده است. نرم افزار MAS براساس روشهای مدل مختلط (MMM) با زبان برنامهنویسی C# تهیه شد. در این نرم افزار از مدل دام برای پیشبینی ارزش ارثی به فرم ماتریسی استفاده شد. با تعیین پلیمورفیسم ناحیه پروموتور ژن DGAT1، پس از استخراج DNA از نمونههای خون، مراحل PCR روی نمونههای DNAانجام گرفت. فراوانیهای آللی و ژنوتیپی حیوانات مشخص شد. از نرم افزار MAS برای پیش بینی ارزش ارثی تعداد 80 رأس از برههای نر گله اصلاح نژادی طرح ملی اصلاح نژاد گوسفند افشاری مزرعه آموزشی دانشگاه زنجان استفاده شد. جهت مقایسه نتایج پیش بینی ارزش ارثی با روش مذکور، از نرم افزار SAS استفاده شد. مقایسه نتایج پیشبینی ارزش ارثی با نرمافزار MAS و SAS، نشاندهنده اثر ورود نشانگرهای مولکولی در انتخاب براساس تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی است. | ||
کلیدواژهها | ||
ارزش ارثی؛ جایگاه صفت کمی؛ گوسفند افشاری؛ نشانگر مولکولی | ||
مراجع | ||
Andersson L. 2001. Genetic dissection of phenotypic diversity in farm animals. Natural Review in Genetics, 2: 130– 138. Dekkers J. C. M. 2004. Commercial application of marker- and gene-assisted selection in livestock: Strategies and lessons. Journal of Animal Science, 82: E313– E328. Fernando R. L. and Grossman M. 1989. Marker assisted selection using best linear unbiased predictin. Genetics Selection Evolution, 467- 477. Goddard M. E. and Hayes B. j. 2007. Genomic selection. Journal of Animal Breeding and Genetics, 124: 323– 330. Henderson C. R. 1976. A simple method for computing the inverse of a numerator relationship matrix used in prediction of breeding values, Biometrics, 32: 69– 83. Heaton M. P., Grosse W. M., Kappes S. M., Keele J. W. and Chitko-McKown C. G. 2001. Estimation of DNA sequence diversity in bovine cytokine genes. Mammalian Genome, 12: 32–37. Koning D. J., Pong- Wong R., varona L., Evans G .J., Giuffra E., Sanchez A., Plastow G., Noguera J. L., Andersson L. and Haley C. S. 2003. Full pedigree quantitative trait locus analysis in commercial pigs using variance components. Journal of Animal Science, 9: 2155-2163. Liviu R. T., Fernando R.L., Dekkers C. M. and Fernandez A. 2004. The effect of using approximate gametic variance covariance matrices on marker assisted selection by BLUP. Genetics, 36: 29– 48. Markovtsova L., Marjoram P. and Tavare S. 2000. The age of a unique event polymorphism. Genetics, 156: 401– 409. Misztal I. 2006. Challenges of application of marker assisted selection– a review. Animal Science Papers and reports, 24: 5- 10. Moreau L., Charcosset A., Hospital F. and Gallais A. 1998. Marker-Assiste Selection Efficiency in Populations of Finite Size. Genetics, 148: 1353-1365 Scate M. C., Napolitano F., Casu S., Carta, A. and Matteis G. 2009. Ovine Acyle CoA: Diacylglycerol acyltransferase 1- milecular characterization, polymorphisms and association with milk traits. Animal Genetics, 40: 737- 742. Williams J. L. 2005. The use of marker-assisted selection in animal breeding and biotechnology .Review in Scince and Technology, 379- 391. Xu Q. L., Chen Y. L. and Xue P. 2008. Polymorphism of DGAT1 associated with intramuscular fat-mediated tenderness in sheep. Scince of Food and Agriculture, 89: 232– 237. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,817 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,548 |