پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 31 |
| تعداد شماره‌ها | 809 |
| تعداد مقالات | 7,785 |
| تعداد مشاهده مقاله | 35,709,648 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 8,010,202 |
مطالعه بیان افتراقی ژن‌های بافت مجرای تخمدان در فاز فولیکولی مرتبط با باروری در بز با استفاده از داده‌های ترنسکریپتومی | ||
| تحقیقات تولیدات دامی | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 12 شهریور 1404 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/ar.2025.30377.1892 | ||
| نویسندگان | ||
| فاطمه اسماعیلی لیما1؛ حسین مرادی شهربابک* 2؛ میلاد غلامی طاحونه1 | ||
| 1گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، شهر کرج ، کشور ایران | ||
| 2گروه علوم دامی -دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی-پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران- خیابان دانشکده | ||
| چکیده | ||
| تخمدان‌ها اندام‌های تولیدمثلی مهمی در پستانداران ماده هستند که مستقیماً بر چرخه فحلی و توانایی‌های تولیدمثلی تأثیر می‌گذارند. هدف این پژوهش، شناسایی ژن‌های مرتبط با تخمدان در بز یونشانگ، شامل دو گروه با میزان باروری پایین و باروری بالا و آنالیز هستی‌شناسی ژن‌های شاخص به منظور شناسایی مسیرهای متابولیکی و فعالیت‌های مولکولی دخیل در مراحل آبستنی است. در این مطالعه، ترنسکریپتوم توالی mRNA ۱۲ نمونه از بافت مجرای تخمدان بزهای سه‌ساله نژاد بز سیاه یونشانگ از پایگاه اطلاعاتی NCBI استخراج و ذخیره شد. پیش‌پردازش داده‌ها با استفاده از نرم‌افزارهای FastQC و Trimmomatic انجام گرفت. آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها با استفاده از بسته نرم‌افزاری Cufflinks و آنالیز هستی‌شناسی ژن‌ها با کمک پایگاه‌های داده DAVID و GENECARD صورت گرفت. در نهایت، ۶۹۰۰۵ شناسه ژن بر روی ترنسکریپتوم دو گروه شناسایی شد، تنها ژن‌هایی با log2 fold change ≥ ±3 و q-value < 0.05 به عنوان ژن‌های شاخص انتخاب شدند که شامل ۲۲ ژن بود. بیشترین میزان بیان در ژن‌های LGALS15، LGALS16، U1 و XLOC_03533 مشاهده شد. شاخص‌ترین ژن از نظر میزان بیان در هر دو گروه، شناسه ژن XLOC_019343 است که در گروه باروری پایین‌تر بیشتر بیان شده اما در پایگاه‌های اطلاعاتی فاقد نام اختصاصی می‌باشد. بیشترین بیان در گروه با باروری بالا مربوط به ژن XLOC_03533 و در گروه با باروری پایین مربوط به ژن‌های LGALS15، LGALS16 و U1 است که بالاترین تفاوت بیان را نیز نشان دادند. این ژن‌ها در فرآیندهایی مانند بازسازی آندومتر، لانه‌گزینی جنین، تشکیل جفت و سازگاری ساختاری و عملکردی مرتبط با فرآیندهای تولیدمثلی نقش دارند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| باروری بالا و پایین؛ بز یوشانگ؛ ترنسکریپتومی؛ فاز فولیکولی؛ مجرای تخمدان | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 27 |
||