| تعداد نشریات | 32 |
| تعداد شمارهها | 819 |
| تعداد مقالات | 7,946 |
| تعداد مشاهده مقاله | 40,890,847 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 8,465,863 |
بررسی چندشکلی ژن STAT5B و ارتباط آن با صفات تولیدی در مرغ بومی فارس | ||
| تحقیقات تولیدات دامی | ||
| دوره 14، شماره 3، آذر 1404، صفحه 23-32 اصل مقاله (1.2 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/ar.2025.29364.1870 | ||
| نویسندگان | ||
| حامد خراتی کوپایی* ؛ محمد دادپسند* | ||
| بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز | ||
| چکیده | ||
| ژنهای STAT کدکننده مجموعهای از پروتئینهای درگیر در مسیرهای انتقال پیام سیتوکینها و هورمونهای پپتیدی هستند و چندین چندشکلی عملکردی از آنها در طیور گزارش شده است. هدف این پژوهش، بررسی چندشکلی ژن STAT5B برای (G4533815A/G-250A) SNP و ارتباط آن با صفات وزن بدن در 12 هفتگی، وزن تخممرغ در 84 هفتگی، شمار تخممرغ و سن اولین تخمگذاری در مرغ بومی فارس بود. تعداد 313 قطعه مرغ ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی با روش PCR-RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. بر این اساس، 128، 174 و 11 فرد بهترتیب دارای ژنوتیپهای AA (بدون جهش)،AG (یک آلل جهشیافته) و GG (دو آلل جهشیافته) بودند. فراوانی آلل A وG بهترتیب 69/0 و 31/0 برآورد شد. آزمون کای مربع، انحراف جمعیت مورد مطالعه از تعادل هاردی-وینبرگ را نشان داد (01/0>P). اختلاف میانه ژنوتیپ AA با ژنوتیپهای GG و AG برای سن نخستین تخمگذاری بر اساس آزمون من-ویتنی، معنیدار بود (05/0>P). ژنوتیپ GG، میانه سن نخستین تخمگذاری کمتری (142 روز) در مقایسه با دو ژنوتیپ AA (150 روز) و AG (147 روز) داشت. بررسی شبکه برهمکنش پروتئینها نشان داد که پروتئین STAT5B در مرغ با مجموعهای از پروتئینهای مربوط به رشد، سیستم ایمنی و تولیدمثلی در ارتباط است که نشاندهنده نقش کلیدی این ژن در کنترل صفات اقتصادی است. یافتههای این پژوهش، دیدگاهی را برای بررسی بیشتر ارتباط بین چندشکلیهای ژن STAT5B و صفتهای مهم اقتصادی و همچنین، کاربرد نشانگرهای ژنتیکی در بهنژادی طیور ارایه میدهد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| چندشکلی ژنی؛ صفات تولیدی؛ مرغ بومی؛ نشانگر ژنتیکی | ||
| مراجع | ||
|
Charoensook, R., Wichasit, N., Pechrkong, T., Incharoen, T., & Numthuam, S. (2016). STAT5B gene polymorphisms are associated with egg production and egg quality traits in laying hens. Asian Journal of Animal and Veterinary Advances, 11, 847-853. doi: 10.3923/ajava.2016.847.853 Cogburn, L. A., Wang, X., Carré, W., Rejto, L., Porter, T. E., Aggrey, S. E., & Simon, J. (2003). Systems-wide chicken DNA microarrays, gene expression profiling, and discovery of functional genes. Poultry Science, 82(6), 939-951. doi: 10.1093/ps/82.6.939 Esfandiari, P., Dadpasand, M., Kharrati-Koopaee, H., Atashi, H., Gharghi, A., & Niazi, A. (2020). Bioinformatics, phylogenetic and variant association analysis of Ovocalyxin-32 gene reveals its contribution to egg production traits in native chickens. Animal Gene, 17, 200108. doi: 10.1016/j.angen.2020.200108 Gholipour, S., Ghavi Hossein-Zadeh, N., Shadparvar, A. A., & Darmani Kuhi, H. (2023). Genetic correlation estimates between direct and maternal genetic effects and estimates of the proportion of maternal permanent environmental variance to phenotypic variance for some important traits in Iranian fowls: A meta-analysis. Journal of Poultry Sciences and Avian Diseases, 1(1), 16-25. doi: 10.61838/kman.jpsad.1.1.2 Jourshari, M. G., Shadparvar, A. A., Ghavi Hossein-Zadeh, N., Rafeie, F., Banabazi, M. H., & Johansson, A. (2023). Genome-wide association study on abdomen depth, head width, hip width, and withers height in native cattle of Guilan (Bos indicus). PLoS ONE, 18(8), e0289612. doi: 10.1371/journal.pone.0289612 Hennighausen, L., & Robinson, G. W. (2008). Interpretation of cytokine signaling through the transcription factors STAT5A and STAT5B. Genes & Development, 22(6), 711-721. doi: 10.1101/gad.1643908 Jamalpour, M., Dadpasand, M., Atashi, H., Niazi, A., Kharrati, H., & Hashemi, S. M. (2018). Bioinformatics and phylogenetic analysis for 5′ UTR region of neuropeptide NPY gene and its association with body weight and egg production traits in Fars native chickens. Iranian Journal of Animal Science, 49(3), 453-458. doi: 10.22059/ijas.2018.262962.653652 [In Persian] Khan, K. I., Hazary, E. H., Miah, G., Das, A., Momin, M., Alvarez-Rodriguez, M., & Rodriguez-Martinez, H. (2024). Effects of STAT5B and BMPR-1B genes on growth and production traits in Red Jungle Fowl, Fayoumi, Hilly chickens, and their crossbreeds. South African Journal of Animal Science, 54(5), 660-672. doi: 10.4314/sajas.v54i5.12 Kharrati-Koopaee, H., Ebrahimie, E., Dadpasand, M., Niazi, A., & Esmailizadeh, A. (2019). Genomic analysis reveals variant association with high altitude adaptation in native chickens. Scientific Reports, 9(1), 9224. doi: 10.1155/2014/837421 Kuhn, M., von Mering, C., Campillos, M., Jensen, L. J., & Bork, P. (2007). STITCH: interaction networks of chemicals and proteins. Nucleic Acids Research, 36(suppl_1), D684-D688. doi: 10.1093/nar/gkm795 Miller, S. (1988). A simple salting-out procedure tissue for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research, 16, 221. doi: 10.1093/nar/16.3.1215 Moradian, H., Esmailizadeh, A. K., Sohrabi, S. S., Nasirifar, E., Askari, N., Mohammadabadi, M. R., & Baghizadeh, A. (2014). Genetic analysis of an F2 intercross between two strains of Japanese quail provided evidence for quantitative trait loci affecting carcass composition and internal organs. Molecular Biology Reports, 41, 4455-4462. doi: 10.1007/s11033-014-3316-1 Niknafs, S., Javaremi, A. N., & Sadeghi, M. (2014). Single nucleotide polymorphisms in BMPR-IB and STAT5B genes and their association with growth and reproductive traits in chicken. Songklanakarin Journal of Science & Technology, 36(2), 137-142. Ou, J. T., Tang, S. Q., Sun, D. X., & Zhang, Y. (2009). Polymorphisms of three neuroendocrine-correlated genes associated with growth and reproductive traits in the chicken. Poultry Science, 88(4), 722-727. doi: 10.3382/ps.2008-00497 Pish Jang Aghajeri, J., Rahimi Mianji, G., Hafezian, S. H., & Gholizadeh, M. (2019). Identification of single nucleotide polymorphisms in IgL and IFNɣ loci in some indigenous chickens. Animal Production Research, 8(1), 67-76. doi: 10.22124/ar.2019.10115.1301 [In Persian] Rostamzadeh Mahdabi, E., Esmailizadeh, A., Ayatollahi Mehrgardi, A., & Asadi Fozi, M. (2021). A genome-wide scan to identify signatures of selection in two Iranian indigenous chicken ecotypes. Genetics Selection Evolution, 53, 1-16. doi:10.1186/s12711-021-00664-9 Sadeghi, M., Niknafs, S., Shahrbabak, H. M., & Fatemi, S. A. (2012). Two SNP in STAT5B gene and their association with breeding value of growth and egg production traits in Mazandaran Indigenous chicken. Livestock Science, 147(1-3), 198-202. doi: 10.1016/j.livsci.2012.04.015. Talebi, R., Szmatoła, T., Mészáros, G., & Qanbari, S. (2020). Runs of homozygosity in modern chicken revealed by sequence data. G3: Genes, Genomes, Genetics, 10(12), 4615-4623. doi:10.1534/g3.120.401860 Telphoni, E., Alijani, S., Hasanpour, K., & Javanmard, A. (2018). Relationship between STAT5B candidate gene polymorphism with growth related traits and ascites index in commercial chicken line. Research On Animal Production, 9(20), 100-109. doi:10.29252/rap.9.20.100 [In Persian] Wang, M.-S., Thakur, M., Peng, M.-S., Jiang, Y., Frantz, L. A. F., Li, M., Zhang, J.-J., Wang, S., Peters, J., Otecko, N. O., Suwannapoom, C., Guo, X., Zheng, Z.-Q., Esmailizadeh, A., Hirimuthugoda, N. Y., Ashari, H., Suladari, S., Zein, M. S. A., Kusza, S., Sohrabi, S., Kharrati-Koopaee, H., Shen, Q.-K., Zeng, L., Yang, M.-M., Wu, Y.-J., Yang, X.-Y., Lu, X.-M., Jia, X.-Z., Nie, Q.-H., Lamont, S. J., Lasagna, E., Ceccobelli, S., Gunwardana, H. G. T. N., Senasige, T. M., Feng, S.-H., Si, J.-F., Zhang, H., Jin, J.-Q., Li, M.-L., Liu, Y.-H., Chen, H.-M., Ma, C., Dai, S.-S., Bhuiyan, A. K. F. H., Khan, M. S., Silva, G. L. L. P., Le, T.-T., Mwai, O. A., Ibrahim, M. N. M., Supple, M., Shapiro, B., Hanotte, O., Zhang, G., Larson, G., Han, J.-L., Wu, D.-D., & Zhang, Y.-P. (2020). 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell research, 30(8), 693-701. doi: 10.1038/s41422-020-0349-y Yang, L., Chen, S., Zhao, W., Zhang, G., Zhang, H., Zhang, T., Xue, L., Tian, J., Gu, Y., Li, L. and Wang, H. (2025). Genome-wide association analysis reveals genetic loci and candidate genes for white diarrhea in Jingyuan chickens. Research in Veterinary Science, 186, 105568. doi: 10.1016/j.rvsc.2025.105568 Zhao, X. H., Wang, J. Y., Zhang, G. X., Wei, Y., Gu, Y. P., & Yu, Y. B. (2012). Single nucleotide polymorphism in the STAT5b gene is associated with body weight and reproductive traits of the Jinghai Yellow chicken. Molecular Biology Reports, 39, 4177-4183. doi: 10.1007/s11033-011-1202-7 | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 134 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2 |
||