پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 31 |
| تعداد شماره‌ها | 792 |
| تعداد مقالات | 7,554 |
| تعداد مشاهده مقاله | 24,670,536 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 7,582,896 |
تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعههای ژنی جهت شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با سازگاری محیطی در برخی از نژادهای گوسفندان ایرانی | ||
| تحقیقات تولیدات دامی | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 24 فروردین 1404 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/ar.2025.29316.1876 | ||
| نویسندگان | ||
| علی نوروزی1؛ محمدحسین مرادی* 2؛ حسین محمدی3؛ امیر حسین خلت آبادی فراهانی4؛ علی اسمعیلی زاده کشکوئیه5 | ||
| 1دانشجو کارشناسی ارشد، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران. | ||
| 2دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران. و دانشیار گروه علوم دامی، دانشکدگان کشاورزی و منابع | ||
| 3استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران | ||
| 4دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران. | ||
| 5استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران | ||
| چکیده | ||
| پژوهش حاضر با هدف مطالعه ارتباط ژنومی (GWAS) بر اساس تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعههای ژنی جهت شناسایی جایگاه‌‌های ژنی مؤثر بر صفات سازگاری با شرایط محیطی با استفاده از اطلاعات آرایه‌‌های ژنومی Illumina Ovine high-density 600K انجام شد. به‌این منظور از اطلاعات ژنوتیپی 139 رأس گوسفندان بومی ایرانی شامل نژادهای کرمانی، سنجابی، لری‌بختیاری، قزل، قره‌گل، سیاه‌کبود، کبوده شیراز افشاری، شال و بلوچی استفاده گردید. ابتدا آنالیز GWAS برای صفات مورد مطالعه در برنامه PLINK انجام شد. سپس ژنهای معنی‌داری که در داخل و یا 50 کیلوباز بالا و پایین دست نشانگرهای معنی‌دار قرار داشتند، شناسایی گردید. در نهایت تفسیر مجموعه ژنی با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژنهای نزدیک به مناطق انتخابی از طریق پایگاه‌‌های بیوانفورماتیکی مختلف انجام شد. نتایج آنالیز GWAS نشان داد که به ترتیب 2431، 2244 و 2145 نشانگر SNP با صفات سازگاری با شرایط محیطی گرمسیری-سردسیری، پراکنش در مناطق با ارتفاع بالا-پایین از سطح دریا و پوشش بدنی پشمی-پوستی در گوسفندان بومی ایران در ارتباط می‌باشند (P-value ≤ 0.05). با تجزیه و تحلیل غنی‌سازی مجموعههای ژنی، مسیرهای زیستی )و ژنهای کاندیدای) مربوط به پاسخ دفاعی به عفونت‌های باکتریایی (HSPA4L، DNAJB4، MSRB3)، تنظیم پاسخ ایمنی به واسطه ایمونوگلوبولین‌ها (IL27A، TRAF3IP2، LY96)، تنظیم فرآیند سیستم رشد و اتصالات سلولی (BMP2، THBS1 و MYH10)، تنظیم اندازه ساختار آناتومی (FGF2، ACTR3)، تنظیم استخوان‌سازی و توسعه اندام (PTBP1 و TMEM117)، و رشد اپیدرم پوست و پشم (KRT71، KR27 و KR25) شناسایی شدند. | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 28 |
||