پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 33 |
| تعداد شماره‌ها | 886 |
| تعداد مقالات | 8,712 |
| تعداد مشاهده مقاله | 55,197,544 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 10,453,371 |
شناسایی و توصیف عملکردی واریانت‌های کوچک ژنومی در مرغ نژاد لگهورن | ||
| تحقیقات تولیدات دامی | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 14 آبان 1405 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22124/ar.2026.34206.1971 | ||
| نویسندگان | ||
| محمد دادپسند* 1؛ ملیکا دهداری1؛ حامد خراتی کوپایی2؛ محمدرضا رضوانی2 | ||
| 1بخش علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز | ||
| 2بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز | ||
| چکیده | ||
| هدف این پژوهش، شناسایی واریانت‌های کوچک ژنومی در مرغ لگهورن و توصیف ارتباط آن‌ها با صفات تولیدی و عملکردی است. داده‌های ژنومی پنج قطعه مرغ لگهورن با پلت‌فرم ایلومیناHiseq-2000 و با طول خوانش15۰ جفت باز بصورت دو طرفه و با عمق خوانش x8 تا x10 توالی یابی شدند. ژنوم مرجع (نسخه 106) و تمامی انوتیشن‌های مرغ اهلی از پایگاه Ensembl دریافت شد. واکاوی داده‌های ژنومی با نرم افزار CLC Genomics workbench نسخه 12 انجام شد. در مجموع 4284712 واریانت‌های کوچک ژنومی شناسایی شد که از این تعداد 15783 واریانت بین پنج نمونه مشترک بودند. برای بررسی عملکرد و نقش واریانت‌های مشترک آنالیز هستی شناسی با استفاده از پایگاه هستی شناسی (geneontology.org) و در سطح معنی‌داری (FDR<0.05) انجام شد. نتایج هستی شناسی در سه سطح فرآیند زیستی، عملکرد مولکولی و اجزای سلولی انجام شد. در سطح فرآیند زیستی، چندین ژن کلیدی مرتبط با صفات مهم اقتصادی شناسایی شد؛ از جمله ژن BSTA که بر سن بلوغ جنسی اثرگذار است. همچنین، واریانت‌های ژنتیکی مربوط به ژن پرولاکتین، مرتبط با صفات تولید تخم مرغ، و ژن IGF1 مرتبط با رشد و بلوغ جنسی، شناسایی شدند. در ارتباط با تشکیل پوسته تخم مرغ، ژن‌های TRPV6، SLC4A9 و ITPR3 شناسایی شدند که در فرآیندهای مانند جابجایی یون‌های بیکربنات و آزادسازی کلسیم از ذخایر درون‌سلولی به ویژه شبکه آندوپلاسمی، نقش مهمی دارند. همچنین، ژن MON2 در ارتباط با شبکه‌ی انتقال مواد در اندامک گلژی گزارش شد که در فرآیندهایی مانند بسته‌بندی و انتقال پروتئین‌های سلولی اهمیت دارد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| توالی‌یابی ژنوم؛ مرغ لگهورن؛ واریانت ژنتیکی؛ صفات تولیدی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 3 |
||